Search
Image Credit: n6

מחשבה מחודשת של ספריית NGS: חדשנות iConPCR של N6

בראיון זה, הצוות ב- N6 דן ב- Thermocycler IconPCR פורץ הדרך וההשפעה שלו על אוטומציה של מעבדה, איכות נתוני NGS ובקרה בזמן אמת במדעי החיים, כולם חיים מ- SLAS 2025.

כדי להתחיל אותנו, האם אתה יכול לתת סקירה של N6 והמשימה שלך במרחב המכשור למדעי החיים?

ב- N6 המשימה שלנו פשוטה אך שאפתנית: אנחנו כאן כדי לספק את הכלים החכמים יותר והניתנים להרחבה שגנומיקה תמיד הייתה זקוקה – אך מעולם לא היה לו. לאחר שני עשורים של התמודדות עם המגבלות של מערכות מדור קודם, הצוות שלנו יצא לחשוב מחדש באופן מהותי כיצד מעבדות מכינות ומעבדות DNA לרצף הדור הבא (NGS). המטרה שלנו? כדי לאפשר לכל מעבדה לייצר נתונים נקיים יותר, מהירים וחסכוניים יותר בקנה מידה-מכיוון שכלים טובים יותר פירושו מדע טוב יותר,D העתיד תלוי בזה. אנו אובססיביים לאיכות נתונים, שלמות מדעית ובניית פתרונות הפותרים למעשה בעיות בעולם האמיתי עבור חוקרים, ולא רק תיאורטיים.

קרדיט תמונה: N6

מה נתן השראה לפיתוח iconPCR, וכיצד חידוש זה מתייחס למגבלות בטכנולוגיית התרמית המסורתית?

IconPCR נולד מתוך תסכול מוחלט מהסטטוס קוו. במשך שנים, המייסד והצוות שלנו ראו את אותן בעיות חוזרות על עצמן: ספריות מוגברות יתר, ריצות רצף מבוזבזות ושונות מאסיבית-כל אלה מונעים על ידי כלים מיושנים שפשוט לא נבנו לקנה מידה או למורכבות של ימינו. מחזות תרמיות מסורתיות מתייחסות לכל מדגם זהה, מה שמוביל לתוצאות "בגודל אחד מתאים לא". ידענו שצריך להיות דרך טובה יותר.

אז, בנינו את iConpcr ™-ה- Thermocycler הראשון בעולם אמת עם 96 בארות נשלטות באופן עצמאיו המשמעות היא שכל מדגם מקבל פרופיל הגברה אופטימלי משלו, בזמן אמת, ללא יותר או תת-רכיבה על אופניים. זה כמו לתת לכל מדגם מאמן אישי משלה, במקום לגרום לכולם לנהל את אותו קצב מרתון.

כאשר iConPCR הוא הראשון מסוגו, אילו אתגרים טכניים התמודד צוות הפיתוח בהשגת שליטה תרמית עצמאית על פני 96 בארות, וכיצד התגברו עליהם?

האתגר העיקרי היה הנדסה 96 אזורים תרמיים מבודדים לחלוטין, שלכל אחד מהם אלמנט וחימום משלו, כולם ארוזים למכשיר ספסל קומפקטי. התאימנו טכנולוגיות מתעשיות המוליכים למחצה וטלקום, שם הדיוק והמהירות הם בעלי חשיבות עליונה, ויישמנו אותן על גנומיקה לראשונה. התוצאה: כל באר ניתנת לתכנות באופן עצמאי, ומאפשרת התאמת פרוטוקול מדויקת לכל מדגם, ללא קשר לסכום הקלט או סוג Assay. זה לא היה הישג קטן, אבל זה מה שמאפשר את הקסם האמיתי של iconPCR – ומה שמבדיל אותו מכל תרמוציקלר אחר בשוק.

כיצד Autonorm ™ מגדיר מחדש את זרימת העבודה הסטנדרטית של PCR, ואילו יתרונות ספציפיים היא מביאה לחוקרים העובדים על הכנת וכימות הספרייה?

Autonorm ™ הוא "Goldilocks" של נורמליזציה של ספריית NGS – מה שהופך כל מדגם "בדיוק נכון." במקום התהליך האינטנסיבי בעבודה, המועדת לשגיאות של טיהור, כימות והתאמת כל מדגם ביד, Autonorm עוקב אחר סינתזת DNA בזמן אמת לכל באר. כאשר מדגם מגיע לנקודת הקצה הרצויה, זה מפסיק לרכוב על אופניים – לא יותר, לא פחות.

יתרונות לחוקרים:

  • לא עוד שלבי כימות או נורמליזציה ידניים– רק בריכה, לטהר וללכת.
  • ספריות עקביות ומוכנות לרצף בכל פעם, עם סיכון מופחת באופן דרמטי להגדלה יתר או תת-תת-או תת.
  • פחות ריצות כושלות, פחות רצף מבוזבז ונתונים אמינים יותר-אפילו עבור דוגמאות מסובכות כמו FFPE או RNA בעל קלט נמוך.

מבחינת איכות ושחזור הנתונים, כיצד ICONPCR משווה למערכות PCR בזמן אמת קונבנציונאלי הן בהגדרות מחקריות והן בהגדרות אבחון?

ICONPCR לוקח איכות נתונים ושחזור לרמה חדשה. מערכות PCR מסורתיות בזמן אמת הן מבוססות אצווה ועיוות לצרכי הדגימה האישיים, ומובילות לעיתים קרובות לתוצאות משתנות ולרצף מבוזבז. המשוב בזמן אמת של ICONPCR, לפי-טוב, מבטיח כי כל מדגם מוגבר בצורה אופטימלית, ישמור על אותות ביולוגיים אמיתיים ומצמצם חפצים.

  • עקביות גבוהה יותר בין דוגמאות: לא עוד "ילדים בעייתיים" בצלחת 96 הבאר שלך.
  • נתוני נאמנות גבוהה: פחות כפילויות PCR, פחות הטיה וייצוג מדויק יותר של הדגימות שלך.
  • תוצאות טובות יותר לתשומות מאתגרות: ICONPCR מאיר עם דגימות מושפלות, קלט נמוך או במגוון גבוה-תוצאות אמינות בהן נכשלות לעתים קרובות מערכות מדור קודם.

בעוד ש- ICONPCR מסומן CE לשימוש מחקרי ולא נוקף FDA לאבחון בארה"ב, זה כבר משנה את ההבדל בהגדרות המחקר התרגומי והפרה-קליני.

במבט קדימה, איך אתה רואה את פלטפורמת ה- iConPCR המתפתחת, ואילו יישומים פוטנציאליים או קהילות משתמשים אתה הכי מתרגש לתמוך?

אנו רואים ב- iConPCR כבסיס לעידן חדש של הכנת ספריית NGS אינטליגנטית ואוטומטית. ככל שהגנומיקה ממשיכה להתקין – ממחקר קליני לחקלאות, ביולוגיה סינתטית ומעבר – הצורך בכלים חכמים יותר, יותר אדפטיביים, רק יגדל.

  • יישומים מרגשים: גנומיקה של תאים יחיד, טרנסקריפטומיקה מרחבית, מעבדות ליבה בעלות תפוקה גבוהה וכל זרימת עבודה בהן איכות ויעילות הנתונים חשובים.
  • קהילות משתמשים: אנו נרגשים במיוחד לתמוך במעבדות המתמודדות עם הדגימות הקשות ביותר – מטגנומיקה, FFPE, CFRNA – ואלה המעוניינים להתגבר מבלי להקריב איכות או לשרוף את הצוות שלהם.

עד כמה SLAs חשובים כאירוע להתחברות למובילי התעשייה וגם למשתמשי הקצה, ואיזה סוג משוב אתה בדרך כלל מתכנס מהוועידה שמודיעה על צינור החדשנות שלך?

SLAS הוא המקום בו עתיד אוטומציה של מעבדה ומדעי החיים מתעורר לחיים. מבחינתנו זו הזדמנות שלא יסולא בפז להתחבר גם למובילי התעשייה וגם למשתמשי קצה. המשוב שאנו אוספים הוא זהב טהור: נקודות כאב בעולם האמיתי, רשימות המשאלות ורעיונות יצירתיים המודיעים על מפת הדרכים של המוצר שלנו. אנו שומעים מה עובד, מה לא, ואילו מעבדות מייחלות הן יכולות לעשות אם רק הכלים היו קיימים.

והשנה, היינו נרגשים במיוחד להכיר כזוכה בפרס מוצר חדש של SLAS לשנת 2025 עבור ICONPCR בוועידת ארה"ב – זה לא כל יום מכשיר הספסל שלך מוכתר כאחת הטכנולוגיות החדשניות ביותר בתחום!

מה הנסיגה האחת שאתה מקווה שחוקרים ומהנדסי אוטומציה יסתלקו איתם לאחר שעסקו בצוות שלכם ב- SLAS 2025?

אל תסתפק ב"ספיקה מספיק "כשאתה יכול להיות" בדיוק נכון. " iconPCR ו- Autonorm אינם רק שיפורים מצטברים – הם חשיבה מהותית של האופן בו הכנת ספריית NGS צריכה לעבוד. אם אתה רוצה נתונים נקיים יותר, זרימות עבודה מהירות יותר ופחות כאבי ראש, הגיע הזמן לשדרג את הכלים שלך. אנו כאן כדי לעזור לך להגביר, לכמת ולנרמל – הכל בבת אחת ללא פשרות.

לבסוף, מה הלאה ל- N6? האם יש משהו חדש שאתה מתרגש לעבוד עליו?

הצוות שלנו כבר קשה לעבוד על תכונות תוכנה חדשות, תאימות assay מורחבת ואוטומציה עמוקה יותר. אנו בוחנים גם שותפויות עם מרכזי מחקר מובילים ומחדשים בתעשייה לדחוף את הגבולות של מה שאפשר בגנומיקה. הישאר מעודכן לפריצות דרך נוספות – ואם יש לך אתגר זרימת עבודה, הביא אותו אלינו. אנחנו אוהבים חידה טובה!

היכן הקוראים יכולים למצוא מידע נוסף?

לקבלת העדכונים האחרונים ב- iConPCR, Autonorm וכל הדברים N6, בקר באתר האינטרנט שלנו (https://www.n6tec.com/) או פנה ישירות לצוות שלנו (https://www.n6tec.com/#contact-us). אנו תמיד שמחים לשתף משאבים, סיפורי הצלחה וקצת מהגישה "Goldilocks" שלנו לגנומיקה.

על המרואיין

ד"ר יאן ג'ובנווט, האב מנהל המוצר ב- N6 הוא אחד החברים הראשונים בצוות N6. עם 20+ שנות ניסיון בביוטק ובאבחון מולקולרי, יאן עוזר להוביל את פיתוח המוצר של iconPCR, כולל שלו ביצועים ביישומים ספציפיים כמו Metagenomics.

דילוג לתוכן