זיהומים פטרייתיים חמורים מסוימים מתרחשים באזורים של ארצות הברית עם סביבות ספציפיות ולעיתים קרובות קשורים לחשיפה לקרקע. זיהומים אלו עלולים להשפיע על אנשים בריאים וגם על אנשים עם דחיקה חיסונית, אך האבחנה הנכונה נשארת אטית, מה שדוחה את הטיפול.
תקן הזהב הנוכחי לביצוע אבחנה מסתמך על התרבות פטרייתית, שיכולה להימשך שבועות, ובדיקות שמחפשות אנטיגנים, חסרי סגוליות, או נוגדנים בדם, שלעתים קרובות אינם אמינים במחלה מוקדמת. אבל כעת חוקרים מאוניברסיטת אינדיאנה ובית הספר לרפואה של IU פיתחו בדיקה מולקולרית חדשה המסוגלת לזהות שלוש פטריות פתוגניות עיקריות בבת אחת – ובתפנית הרבה יותר מהירה משיטות מסורתיות.
העבודה תוצג במפגש השנתי והאקספו של האגודה לפתולוגיה מולקולרית (AMP) 2025, שיתקיים ב-11-15 בנובמבר בבוסטון.
ד"ר קנת גאווינה, Ph.D., הוא מנהל המיקרוביולוגיה הקלינית בחברת Eskanazi Health באינדיאנפוליס. הוא פיקח על הפרויקט באמצעות בית הספר לרפואה של אוניברסיטת אינדיאנה. הצוות שלו ביקש לזהות שלושה זיהומים פטרייתיים המשפיעים על אלפי אנשים מדי שנה, לעתים קרובות נחשבים בטעות למחלות נשימתיות אחרות, ויכולים להיות מסכני חיים, במיוחד אצל אנשים עם דחיקה חיסונית:
- היסטופלסמוזיס מופיע בדרך כלל כזיהום ריאות בחולים ששאפו אדמה המכילה צואת ציפורים או עטלפים. זה נפוץ ביותר בעמקי נהר אוהיו ומיסיסיפי.
- בלסטומיקוזיס מופיע גם כזיהום ריאות, אך גם יכול להתקדם ולהשפיע על העור, העצמות ואיברים אחרים. זה מתרחש בעיקר במרכז ובדרום מזרח ארה"ב
- Coccidioidomycosis מכונה בדרך כלל קדחת העמק. למרות שרוב זיהומי הריאות הללו הם קלים, חלק מהחולים מפתחים דלקת ריאות חמורה או חווים זיהום במקומות אחרים בגוף. זה מתרחש בעיקר במדינות דרום מערביות, כולל אריזונה, קליפורניה וניו מקסיקו.
החוקרים תכננו בדיקת PCR מרובת בזמן אמת, מה שאומר שהיא יכולה לזהות מספר פתוגנים בו זמנית מאותה דגימה.
הבדיקה שלהם מכוונת לשלושה אזורים גנטיים שהם ייחודיים לכל פטרייה: ITS1 for היסטופלזמהBAD1 עבור Blastomycesוגן A2/PRA עבור Coccidioides. על ידי זיהוי ישיר של החומר הגנטי של הפטריות, בדיקת ה-PCR עוקפת את תהליך ההתרבות האיטי המסובך בשל יכולת הפטריות לעבור בין צורות סביבתיות לבני אדם.
כשהם השוו את תוצאות ה-PCR שלהם לשיטות מעבדה סטנדרטיות, בדיקת ה-PCR זיהתה את כל הדגימות שנבדקו עם דיוק של 100%. בנוסף, זה היה 100% ספציפי, כלומר הוא לא זיהה בטעות פטריות או מזהמים אחרים.
זרימת העבודה גם מבטלת את הצורך בצעדי מיצוי DNA גוזלים זמן, מה שעלול להפחית את זמן הסבב ואת הסיכון המעבדתי הקשור לטיפול בפטריות פתוגניות חיות.
לבדיקה שלנו יש פוטנציאל לשפר באופן משמעותי את זמן האספקה ואת הביטחון האבחוני עבור זיהומים שבעבר היה קשה לזהות במהירות."
ד"ר קנת גאווינה, Ph.D., מנהל מיקרוביולוגיה קלינית, Eskanazi Health, אינדיאנפוליס
חשוב לציין, המערכת של הצוות פועלת על פלטפורמה שכבר נעשה בה שימוש במעבדות קליניות רבות, מה שהופך אותה לנגישה למדי.
"בעוד אימות קליני נוסף מתבצע, בדיקה זו מראה פוטנציאל חזק למלא פער גדול באבחון פטרייתי", אמר גאווינה. למבחן יש את היכולת לזהות את שלושת הגורמים העיקריים למיקוזים אנדמיים בארצות הברית ישירות מדגימות קליניות או לשמש כצורה של זיהוי סופי מהתרבות פטרייתית. "לרופאים אין כיום בדיקות מולקולריות שאושרו על ידי ה-FDA עבור שלושת הפתוגנים הללו, מה שהופך את הזיהוי המהיר והאמין לצורך דחוף."
עבודה זו נוהלה על ידי ד"ר קנת גאווינה, Ph.D., עוזר פרופסור לפתולוגיה קלינית ולרפואת מעבדה בבית הספר לרפואה של IU, והיא תוצג לאחד ממדעני המעבדה הרפואית ב-IU Health, Kylee Alexander, במהלך מושב פוסטרים בשעה 9:15 בבוקר ביום שישי, 14 בנובמבר, במרכז הכנסים והתערוכות של תומס מ. מנינו בבוסטון. מספר הכרזה של אלכסנדר הוא ID008. גאווינה תהיה זמינה לדון בעבודה עם כתבים.
