שנג'ן, סין, 6 ביוני 2024 – MGI Tech Co., Ltd. ("MGI"), חברה המחויבת לבניית כלים וטכנולוגיות ליבה המניעות חדשנות במדעי החיים, הכריזה היום על פתרון זרימת עבודה מלאה יעילה ביותר עבור רצף גנום שלם בקנה מידה גדול בחקלאות במעבר נמוך ( Low-pass WGS) המבוססת על פלטפורמות ה-DNBSEQTM הקנייניות שלה במהלך כנס הגנום הבינלאומי לצמחים ובעלי חיים באסיה (PAG Asia 2024), המתקיים ב-5-7 ביוני בשנג'ן, סין.
קרדיט תמונה: MGI
הפתרון החדש מורכב מפורטפוליו אוטומטי של תהליכים מלאים המיועד לגנוטיפים רבייה מולקולרית בקנה מידה גדול של מינים דיפלואידים חקלאיים. זרימת העבודה המלאה מכסה חילוץ, הכנת ספרייה, רצף וקריאות SNP ו-InDel.
ערכת הכנה לספריית FS בקנה מידה גדול של MGIEasy החדש בקנה מידה גדול ללא PCR עבור WGS במעבר נמוך, זמין בשני מפרטים, 96RXN ו-384RXN, תוכנן במיוחד עבור יישומי WGS במעבר נמוך עם מודול מגיב חדש להכנת ספרייה מבוסס צלחת. בהשוואה לערכות הכנה נפוצות של ספרייה ללא PCR בשוק, ערכה זו חותכת את שלב הטיהור ומשלימה את בניית הספרייה בשלושה שלבים קלים, ומצמצמת את הזמן והחומרים המתכלים הנדרשים.
בשילוב עם פלטפורמות האוטומציה המתקדמות של MGI, פתרון Low-pass WGS פורץ את מגבלת התפוקה כפי שניתן לראות בהכנת ספרייה רגילה. הוא משתמש במספר קטן יותר של כלים אוטומטיים כדי להתאים לתפוקה גבוהה במיוחד, כמו תוך שמירה על רמה גבוהה של אוטומציה. כתוצאה מכך, ניתן לבצע הכנת ספרייה בקנה מידה גדול בזמן קצר, בעלות נמוכה ובידידותיות רבה לאוטומציה.
עבור רצף, חבילות המוצרים לתפוקה גבוהה ותפוקה בינונית WGS עם מעבר נמוך כוללות את הרצף DNBSEQ-T7 בעל תפוקה גבוהה במיוחד ואת הרצף DNBSEQ-G400 הבנצ'טופ התכליתי בהתאמה, מה שמעצים פרויקטים של מחקר גנומיקה חקלאית בקנה מידה גדול בזמן קצר.
זרימת העבודה הראשונית ששוחררה כוללת פאנל התייחסות לחזירים ותוכנת ניתוח נתונים שהתבססה על GLIMPSE2, המאפשרת למשתמשים לבצע גנוטיפ חזירים מבלי לבנות מסד נתונים משלהם. שירות המרת פורמט חינם זמין גם למשתמשים עם לוח התייחסות קיים כדי להיות תואם לתוכנת הניתוח.
"מכיוון שברירת הגנום הייתה בשימוש נרחב בגידול חקלאי, כלי הגנוטיפים עברו מספר חזרות, טכנולוגיית רצף מראה בהדרגה את היתרונות הבלתי ניתנים להחלפה שלה", אמר דאנקן יו, נשיא MGI. "WGS עם מעבר נמוך יושם הן בגידול בעלי חיים והן בגידול צמחים, אך לא ללא אתגרי יישום. הפתרון הכולל החדש שלנו לגידול חזירים בקנה מידה גדול נותן מענה לנקודות הכאב הללו של המשתמשים ומבטיח צרכי אוטומציה גמישים, הכנת ספרייה פשוטה, רצף תפוקה גבוהה ועיבוד נתונים יעיל".
קרדיט תמונה: MGI
מחוזק על ידי מכשירי הכוח של MGI, לפתרון WGS חקלאי נמוך מעבר זה יש תפוקה יומית של 96 עד 1,536 דגימות ותפוקה שנתית של 24,000 עד 384,000 דגימות (בהתבסס על עומק פי 1.0 של גנום חזיר ותפוקת נתוני דגימה ממוצעת של 3G) . הוא גם השיג תוצאות SNP ברמת דיוק גבוהה מ-0.5~1X Low-pass בדגימות רקמת אוזני חזיר, המדגימות עקביות של 98.4% עם מערך SNP ו-98.1% עם 50X WGS. יחד עם מאיץ ניתוח ביואינפורמטיקה MegaBOLT שפותח בעצמו של MGI, הוא יכול לנתח 192 דגימות חזיר 1.0X מדי יום, וכ-1,536 ליום עם ZBOLT Pro.
בהשוואה לגנוטיפים מסורתיים באמצעות מיקרו-מערך, הפתרון החדש של MGI מציע נתונים רחבי גנום באותה עלות, אך לוכד מגוון רחב יותר של שונות גנטית, משפר את הגילוי של גרסאות חדשות ומגביר את הכוח הסטטיסטי של מחקרים רחבי גנום, כל זאת תוך ביטול גבוה עלויות עיצוב והקמה הקשורות למיקרו-מערכים. התכונות הדינמיות של פתרון זה מאפשרות עדכונים ואופטימיזציות מתמשכים בניתוחים גנומיים.
"כספקית של כלי ליבה במדעי החיים, MGI מחויבת לספק למדענים ולמגדלים חקלאיים מוצרי גנום איכותיים, נוחים ואמינים, תוך הנעה אקטיבית של הצמיחה של המחקר והתעשייה החקלאית", הוסיף יו.
המוצר וזרימת העבודה של WGS עם מעבר נמוך יהיו זמינים להזמנות החל מה-30 ביוני. למידע נוסף על זרימת העבודה המלאה העדכנית ביותר של MGI בקנה מידה גדול לחקלאות Low-pass WGS, אנא בקר בכתובת https://en.mgitech.cn/Home/Applications/index/id/16.html.
על MGI
MGI Tech Co., Ltd. (או החברות הבנות שלה, המכונה יחד MGI) מחויבת לבנות כלים וטכנולוגיות ליבה המניעות חדשנות במדעי החיים. המיקוד שלנו נמצא במחקר ופיתוח, ייצור ומכירה של מכשירים, ריאגנטים ומוצרים נלווים בתחום מדעי החיים והביוטכנולוגיה. אנו מספקים בזמן אמת, מולטי אומיקה וספקטרום מלא של ציוד ומערכות דיגיטליות לרפואה מדויקת, חקלאות, בריאות ותעשיות שונות אחרות. MGI, שנוסדה ב-2016, הפכה למובילה בתחום מדעי החיים, משרתת לקוחות בשש יבשות והקימה מתקני מחקר, ייצור, הדרכה ושירות לאחר מכירה ברחבי העולם. MGI בולטת כאחת החברות הבודדות המסוגלות לפתח ולייצר באופן עצמאי רצפי גנים ברמה קלינית עם יכולות תפוקה משתנות, החל מרמות Gb ועד לרמות Tb. עם מומחיות שאין שני לה, מוצרים חדשניים ומחויבות להשפעה גלובלית, MGI ממשיכה לעצב את המסלול של מדעי החיים אל העתיד. למידע נוסף, בקר בכתובת mgi-tech.com/, LinkedIn, X ו-YouTube.
