Lexogen, מובילה בטכנולוגיות רצף RNA, נרגשת להכריז על השקת ערכת RiboCop rRNA Depletion for Fish, פתרון ייעודי להקלת ניתוח התעתיקים של מיני דגים על ידי הסרה יעילה של RNA ריבוזמלי (rRNA) לא רצוי מדגימות RNA הכוללות.
ניתוח תעתיק ללא הפרעה עבור דגים
דג זברה (דניו ריו) הוא אורגניזם מודל חשוב לביולוגיה התפתחותית ומשמש גם כמודל מחלות אנושיות לבדיקת תרופות וגילוי סמנים ביולוגיים. מיני דגים אחרים הם אינדיקטורים חשובים המשמשים למעקב סביבתי או משמשים לייצור מזון בחקלאות ימית. ניתוח תעתיק של מיני דגים שונים מספק תובנה לגבי תהליכי התפתחות ורגולציה, מאפשר לנטר את איכות התנאים הסביבתיים או לזהות זיהומים עם פתוגנים ותגובות חיסוניות.
ה-RNA הכולל מדגים מורכב בעיקר מ-RNA ריבוזמלי (rRNA), המהווה ~86% מכלל התמלילים. ערכת RiboCop rRNA Depletion for Fish מסירה ביעילות ציטופלזמה לא רצויה (5.8S, 18S ו-28S) ומיטוכונדריה (mt16S, mt12S ו-5S), ומספקת תצוגה מקיפה של תעתיק הדג. Ribodepletion מאפשר ניתוח של mRNA מקודדים כמו גם תעתיקים לא מקודדים ולא פוליאדנילטים לתובנות מעמיקות יותר לגבי תעתיקי דגים ורשתות ביטוי המכסות מגוון תת-סיווגים של RNA.
אינטגרציה חלקה עם רצף הדור הבא
RiboCop משתמשת בסט של בדיקות זיקה ובזרימת עבודה נטולת אנזים המשמרת תמלילים באורך מלא. לכן, RiboCop מתאים באופן מושלם עבור יישומי רצף הדור הבא (NGS) והוא גם תואם לרצף קריאה ארוכת טווח.
RiboCop for Fish משתלב בצורה חלקה עם ערכות ההכנה לספריית CORALL RNA-Seq V2 של Lexogen לרצף במכונות Illumina או AVITI של Element. RiboCop תואם גם לערכות הכנה של ספריית RNA הכוללות RNA מפותחות באופן אקראי של ספקים אחרים, מה שמבטיח גמישות בתהליכי עבודה ניסיוניים.
טכנולוגיה מהימנה ודלדול משותף נוח בשלב אחד לניתוח מרובה מינים
RiboCop מבוססת היטב עבור דלדול rRNA וגלובין של אדם/עכבר/עכבר, דלדול של דגימות חיידקים, שמרים וצמחים. עם התוספת האחרונה עבור דלדול דגימות דגים, תאימות המינים של RiboCop מורחבת עוד יותר. ניתן לשלב בקלות ערכות של RiboCop כדי לאפשר דלדול משותף של מארח ופתוגן בו-זמנית ובשלב אחד, המציעות תובנות לגבי אינטראקציות בין דגים לפתוגן, תגובה חיסונית ומנגנוני הגנה.
ערכת RiboCop rRNA Depletion for Fish זמינה כעת להזמנה.
