חיידקים האורבים בבשר שנקנה בחנות יומיומית עשויים לגרום לאלפי זיהומים בדרכי השתן, במיוחד בקהילות בעלות הכנסה נמוכה.
מחקר: Zoonotic Escherichia coli וזיהומים בדרכי השתן בדרום קליפורניה. קרדיט תמונה: Sergey Ryzhov/Shutterstock.com
*הודעה חשובה: mBio מפרסם דוחות מדעיים ראשוניים שאינם נבדקים על ידי עמיתים, ולכן אין לראות בהם מכריעים, מנחים פרקטיקה קלינית/התנהגות הקשורה לבריאות, או להתייחס אליהם כאל מידע מבוסס.
דלקות בדרכי השתן (UTI) נפוצות ברחבי העולם ונגרמות בעיקר על ידי Escherichia coli (E. coli). במקרים מסוימים, חיידק זה עשוי להירכש באמצעות צריכת בשר מבעלי חיים נגועים, המסלול הזואונוטי. מחקר שפורסם לאחרונה ב מיקרוביולוגיה קלינית בוחן את השיעור של UTI באזור המטרופולין שנגרם על ידי פתוגניים חוץ מעיים זואונוטיים E. coli (ExPEC) בדרום קליפורניה.
מָבוֹא
E. coli מיישב בני אדם ובעלי חיים, כולל אלה המבויתים לבשר. זיהומים הנגרמים על ידי חיידק זה גורמים לפי הערכות למיליון מקרי מוות ברחבי העולם מדי שנה.
זני ExPEC גורמים לזיהומים מעבר למעי, כולל UTIs, דלקת שלפוחית השתן, פיילונפריטיס, אלח דם ודלקת קרום המוח. כשמונה מיליון UTI מתרחשים מדי שנה בארצות הברית לבדה. הם משפיעים באופן משמעותי על הפרודוקטיביות ועל העלות של שירותי הבריאות. רבים הופכים לזיהומים חמורים, כאשר UTI אחראים ליותר ממחצית מהאלח דם עקב E. coli.
חיות מזון עשויות להיות אחראיות למיעוט בולט של זיהומים חיידקיים אלה, יותר ממה שחשבו בעבר. עם זאת, התרומה של ה-ExPEC הזואונוטית לנטל ההדבקה נותרה לא ברורה, בעיקר בגלל שזיהומים אלה הם בדרך כלל ספורדיים ומכיוון שמעל תשעה מיליארד בעלי חיים גדלים לבשר בארה"ב. בהתחשב בכך E. coli הוא חיידק נפוץ באוכלוסיות בני אדם ובעלי חיים כאחד, קשה להבחין בין זנים ספורדיים לבין זנים אנדמיים.
שיטת תקן הזהב היא ניתוח פילוגנטי של גנום ליבה, המשמש בדרך כלל כדי לאתר את המקור של התפרצות זיהומית. עם זאת, זה דורש מדגם מייצג גדול של האוכלוסייה החשודה. עם זאת, גם בלי זה, ניתן להשתמש בו כדי לזהות את המין המארח העיקרי.
המחקר הנוכחי השתמש במודל ייחוס גנומי מסוג בייסיאני סמוי על קבוצה גדולה של E. coli מבודדים. שיטה סטטיסטית-גנומית זו משלבת פילוגניית גנום ליבה עם אלמנטים גנטיים ניידים (MGEs) המראים הבדלים ניתנים להבחנה בין חיות מזון לבני אדם. שיטה זו העריכה את אחוז הזנים הזואונוטיים התורמים לנטל UTI הכולל בדרום קליפורניה. המטרה הייתה להשיג תובנות מעשיות לגבי הסיכון להדבקה בזנים אלה.
לגבי המחקר
המחקר כלל שמונה מחוזות בדרום קליפורניה ונמשך בין 2017 ל-2021. החוקרים השיגו 12,616 מבודדים של E. coli מבשר קמעונאי ו-23,483 מחולים עם UTI, תוך שהם מחפשים להשוות אותם עם מדגם מייצג של 5,728 מבודדים.
ממצאי המחקר
משתתפי המחקר כללו בעיקר נשים, עם גיל חציוני של 50. כ-37% היו היספנים, ו-31% היו לבנים.
E. coli הזיהום היה הגבוה ביותר בטורקיה (82%) ונע בין 47% ל-58% עבור בשר בקר, עוף ובשר חזיר בבשרים הקמעונאיים שנדגמו. הדגימות המזוהמות ביותר היו משכונות עניות, עם שיעורי זיהום גבוהים ב-12% על כל עלייה מוחלטת של 10% בשיעור העוני במשפחה באזור זה. גם חבילות ערך היו מזוהמות יותר.
דפוס זה עשוי לשקף טיפול לא נכון בבשר, טמפרטורות אחסון לא נאותות או תקופות אחסון ממושכות. תנאים סוציו-אקונומיים וגישה למשאבי בטיחות מזון עשויים להשפיע על זיהום וסיכון לזיהום.
גברים מבוגרים היו בעלי סיכוי גבוה יותר ללקות בזיהומים זואונוטיים, הגיל החציוני היה 73, בהשוואה ל-65 עבור אלו עם זיהומים לא-זונוטיים. זני ExPEC Zoonotic היו שכיחים יותר בנשים מאשר בגברים, ב-20% לעומת 8.5%, בהתאמה.
סוגי רצף ייחודיים היו שימושיים בהבחנה של בידודים לפי מקורם. סוגי רצף מבודדים קליניים היו שונים מאלה ששלטו בבידודי בשר. דפוס התפוצה שלהם גם הבחין בין זני ExPEC זואונוטיים לבין זני ExPEC שאינם זוונוטיים.
MGEs גם הראו דפוסי העשרה שהיו שונים בבידודים אנושיים מאשר בבשר. לבידוד בשר עוף והודו היו אלמנטים כמו M1, M2, M4 ו-M5 בתדירות גבוהה. לעומת זאת, אלמנטים הקשורים לאדם כגון H2, H3 ו-H6 היו בסבירות גבוהה יותר במבודדים מ- UTI.
בסך הכל, כמעט אחד מכל חמישה (18%) UTIs היו קשורים לזני ExPEC שמקורם בחיות מזון. השיעור עלה ל-21.5% בשכונות עניות, סיכון גבוה פי 1.6 מאשר באזורי עוני נמוכים.
חלק גדול מזני ExPEC שנמצאו בדגימות UTI קליניות היו קשורים לכמה E. coli זנים בקבוצות הפילוגריות B2 ו-D מבודדות מבשר, מה שמרמז על זנים ארסיים במיוחד אלה ממלאים תפקיד מפתח בסיכון UTI זואונוטי, כנראה בגלל הארסיות שלהם. הממצאים לפיהם השכיחות של זנים אלה במחלות UTI זונוטיות לא שיקפו ישירות את השפע שלהם בדגימות בשר תומכים בכך. נראה כי בשר עופות, במיוחד הודו, הוא הסיכון הגבוה ביותר מבין כל המזונות מהחי לזיהום אלים הקשור ל-ExPEC.
זנים זואונוטיים הראו גנים של עמידות אנטי-מיקרוביאלית בינונית בין הבידודים הקליניים לבין הבידודים שמקורם בבשר. הם היו בעלי סבירות נמוכה יותר להראות עמידות לריבוי תרופות מאשר בידודים לא-זונוטיים, אך לא היו שונים מבדידים של בשר. גם בידוד זואונוטי וגם בשר היו עמידים פחות לתרופות אנטי-מיקרוביאליות נפוצות, למעט טטרציקלינים.
עם זאת, זנים קליניים זואונוטיים ולא-זונוטיים היו בעלי סיכוי נמוך יותר להראות עמידות לגנטמיצין מאשר בידודי בשר. זה עשוי לשקף שינויים רגולטוריים וחקלאיים, כגון שימוש מופחת בתרופות אנטי-מיקרוביאליות בבעלי חיים תחת מדיניות כמו חוק 27 של הסנאט של קליפורניה, שהורידו את העמידות בקרב חיידקים הקשורים למחלות UTI זוונוטיות.
מסקנות
ממצאים אלה מדגישים את התרומה של ExPEC הזונוטית לנטל UTI בדרום קליפורניה ואת הצורך בהתערבויות ממוקדות להפחתת הסיכון בקהילות פגיעות.
כאשר כמעט חמישית ממקרי UTI באוכלוסיה זו קשורים לזני ExPEC זואונוטיים, מחקר זה מצביע על הדחיפות של תכנון התערבויות בטיחות מזון כדי להפחית את השכיחות של זנים אלו באספקת המזון, במיוחד בשר עופות.
המחברים גם מציינים מגבלות: המודל לא הצליח להבחין בין כל מקורות הבשר, במיוחד בקר, והמחקר התמקד בעיקר בזיהומים שנרכשו על ידי הקהילה, מה שעלול לזלזל בתרומה הזואונוטית המלאה.
נדרשת עבודה נוספת כדי לבסס את הערך הקליני של הפחתת השימוש בתרופות אנטי-מיקרוביאליות רלוונטיות מבחינה קלינית בחיות מזון, מה שעלול להפחית עמידות לאנטי-מיקרוביאלית בזיהומים בבני אדם. בינתיים, קבוצות בסיכון גבוה כמו מבוגרים מדוכאי חיסון ומבוגרים צריכות להיות זהירות כאשר הן מתמודדות עם כל צורה של בשר נא, לשים לב להיגיינת הידיים ולהימנע מזיהום צולב, תוך הקפדה על בישול בשר יסודי לפני הצריכה.
הורד את עותק ה-PDF שלך עכשיו!
*הודעה חשובה: mBio מפרסם דוחות מדעיים ראשוניים שאינם נבדקים על ידי עמיתים, ולכן אין לראות בהם מכריעים, מנחים פרקטיקה קלינית/התנהגות הקשורה לבריאות, או להתייחס אליהם כאל מידע מבוסס.
