רקע ומטרות
קרצינומה כבדית (HCC) היא אחת המחלות הממאירות הקטלניות ביותר. מנגנונים אפיגנטיים גילו ש-RNA לא מקודדים, כגון microRNAs (miRNAs) ו-RNAs מעגליים (circRNAs), מעורבים בהתקדמות HCC. מחקר זה נועד לבנות רשת circRNA-miRNA-mRNA ב-HCC ולאמת ציר אחד בתוך הרשת.
שיטות
נתוני תעתיק הקשורים ל-HCC התקבלו מה- Gene Expression Omnibus, וגנים הקשורים ל-HCC הגיעו מ- GeneCards כדי לזהות circRNAs ו-miRNAs בעלי ביטוי דיפרנציאלי. יחסי המיקוד בין אינטראקציות circRNA-miRNA ו-miRNA-mRNA נחזו. המעורבות של ציר hsa_circ_0001726/miR-140-3p/KRAS ב-HCC הוערכה באמצעות ניסויים תאיים וניתוחי הישרדות.
תוצאות
זיהינו שישה circRNAs בעלי ביטוי דיפרנציאלי ב-HCC, שהיו מקושרים ל-13 miRNAs ו-88 mRNAs. נבנתה רשת המכילה 34 זוגות circRNA-miRNA ו-194 זוגות miRNA-mRNA. מבחני התפשטות והגירה של תאים אישרו את תפקידו של hsa_circ_0001726 בקידום התקדמות HCC, אולי דרך ציר miR-140-3p/KRAS. ניתוח הישרדות אימת כי hsa_circ_0001726 היה גורם פרוגנוסטי להישרדות כוללת בחולים עם HCC. ציר hsa_circ_0001726/miR-140-3p/KRAS מתווך גם תנגודת lenvatinib בתאי HCC.
מסקנות
רשת HCC circRNA/miRNA/mRNA מספקת תובנות חדשות לגבי מנגנון הרגולציה שלאחר התעתיק של HCC. ציר hsa_circ_0001726/miR-140-3p/KRAS מעורב בהתקדמות HCC ובהתנגדות ל-lenvatinib.
