חוקרים מאוניברסיטת אינדיאנה מלווין ומרכז הסרטן המקיף ברן סיימון השלימו את המיפוי הנרחב ביותר של תאי שד בריאים עד כה. ממצאים אלו מציעים כלי חשוב לחוקרים ב-IU ומחוצה לה כדי להבין כיצד מתפתח סרטן השד ואת ההבדלים ברקמת השד בין אבות גנטיות.
פורסם החודש ב רפואת טבעחוקרים פיתחו אטלס מקיף של תאי רקמת שד – כולל פרטים על האופן שבו הגנום מאורגן בכל סוג תא והשפעות ארגון הגנום הזה על האופן שבו RNA נוצר בכל סוג תא כדי להניע את תפקודם בחלקים שונים של השד – באמצעות רקמת שד בריאה מנשים ממוצא מגוון.
סרטן השד מראה שונות בתוצאה בהתבסס על מוצאך הגנטי. בעוד שכלכלה-חברתית היא בהחלט גורם תורם, אנו מאמינים שגם ביולוגיה ומוצא ממלאים תפקיד. המחקר הזה יעזור לנו לטפל בהיבט הביולוגי, האבותי הזה".
Harikrishna Nakshatri, PhD, מחבר בכיר של המחקר
נקשאטרי הוא פרופסור מריאן ג'יי מוריסון לחקר סרטן השד בבית הספר לרפואה של IU וחוקרת של קרן ורה בראדלי לחקר סרטן השד במרכז IU Simon Comprehensive Cancer.
המעבדה של נקשאטרי רצתה 88,000 גרעיני תאים מ-92 נשים שתרמו רקמת שד בריאה לבנק רקמות קומן במרכז IU Simon Comprehensive Cancer. התורמים כללו אנשים ממוצא אפריקני, אירופאי, ילידי אמריקאי, היספני, מזרח אסיה, דרום מזרח אסיה ואשכנזי-יהודי-אירופי.
מיפוי התאים כולל נתונים לא רק על הגנים המתבטאים בסוגי תאים שונים, אלא גם על האופן שבו הגנים מאורגנים ואילו ביטויי גנים ספציפיים מוגבלים לכל סוג תא. חוקרים יודעים שסרטן השד מקורו לרוב בסוגי תאים ספציפיים והמקום שבו הוא מקורו מוביל לסוגי סרטן ותגובות שונות לטיפול. מחקר זה יכול לשפר את ההבנה של התפתחות סרטן השד ולהוביל לזיהוי יעדי טיפול חדשים.
"מחקר זה נועד להבין את אבני הבניין של השד הרגיל – כלומר כמה סוגי תאים שונים קיימים בשד הרגיל והאם אבני הבניין של התאים מראות שונות תלוית אבות גנטית", אמר נקשאטרי. "אלא אם כן אנחנו יודעים מאילו סוגי תאים של השד מקור הסרטן, אנחנו לא באמת יכולים להבין מה בדיוק משתבש בסרטן השד בהשוואה לשד הרגיל".
משאבי מחקר זמינים בעבר השתמשו ברקמה נורמלית מניתוחי סרטן שד ודגימות מממופלסטיות הפחתות. בנק רקמות קומן, בנק רקמות השד הבריאה היחיד בעולם, מציע לחוקרים ב-IU הזדמנות ייחודית למחקר זה.
"אנחנו משתמשים ברקמה מנשים שהן נקיות מבחינה קלינית מסרטן השד; מסיבה זו, אנו מאמינים שהנתונים שיצרנו קרובים למושלמים – באמת הכי קרוב שאפשר להגיע", אמר נקשאטרי. "הנתונים שהפקנו מזה הולכים להישאר לנצח כי הם ישמשו הרבה מאוד קבוצות למחקר עתידי".
המידע על אטלס התא מהמחקר יהיה זמין באופן נרחב לחוקרי סרטן השד באמצעות מאגרי מידע המוצעים על ידי המכון הלאומי לבריאות, Human Cell Atlas ו-Chan Zuckerberg CELL מאת GENE Discover.
מחקר זה הוא השיא של כמעט חמש שנים של עבודה אינטנסיבית ממעבדת נקשאטרי ועם ניתוח ביואינפורמטי. מחברים נוספים של בית הספר לרפואה של IU ומרכז IU Simon Comprehensive Cancer כוללים את Poornima Bhat-Nakshatri, Hongyu Gao, Aditi S. Khatpe, Adedeji K. Adebayo, Patrick C. McGuire, Cihat Adogan, Duojiao Chen, Guanglong Jiang, Rana German, Lydia Emmert , ג'ורג' סנדוסקי, אנה מריה סטורניולו ויונלונג ליו.
