צוות של חוקרי סרטן, בראשות אוניברסיטת יוסטון, גילה תת-קבוצה חדשה של תאי T שעשויה לשפר את התוצאה עבור חולים המטופלים בטיפולים בתאי T.
לאימונותרפיה מבוססת תאי T יש ערך עצום להילחם, ולעתים קרובות לחסל, בסרטן. האסטרטגיה מפעילה את מערכת החיסון של המטופל ומהנדסת את תאי ה-T של המטופל כדי לזהות, לתקוף ולהרוג תאים סרטניים. בדרך זו הופכים תאי ה-T של הגוף עצמו לסמים חיים.
בעוד שטיפול חיסוני בתאי T חולל מהפכה בטיפול בסרטן, יש עדיין הרבה מה ללמוד. למרבה הצער, לא כל המטופלים מגיבים לטיפולים אלו, ולכן יש צורך בהבנה טובה יותר של התכונות של תאי T מהונדסים כדי לשפר את התגובות הקליניות.
מחקר אחד כזה, הנתמך על ידי מענק מהמכונים הלאומיים לבריאות, מדווח ב סרטן הטבע על ידי המעבדה של Navin Varadarajan, MD אנדרסון פרופסור במחלקה של ויליאם א. ברוקשייר להנדסה כימית וביו-מולקולרית. המחקר משתמש בגישת TIMING המוגנת בפטנט (Timelapse Imaging Microscopy in Nanowell Grids) המיישמת בינה מלאכותית חזותית כדי להעריך את התנהגות התא, התנועה והיכולת להרוג.
"התוצאות שלנו הראו שתת-קבוצה של תאי T, המסומנים כתאי T מתאימים ל-CD8, מסוגלים לבצע תנועתיות גבוהה והרג סדרתי, שנמצאו באופן ייחודי בחולים עם תגובה קלינית", מדווח המחבר הראשון ובוגר UH לאחרונה, עלי רזבן ב- סרטן הטבע. בנוסף לצוות UH, משתפי הפעולה כוללים את Sattva Neelapu ואת Harjeet Singh, אוניברסיטת טקסס MD Anderson Cancer Center, יוסטון; מייק מאטי, קייט פארמה; נביל אחמד, בית החולים לילדים בטקסס, Baylor College of Medicine, יוסטון; ו-Mohsen Fathi, CellChorus.
כדי לגלות את התאים המותאמים ל-CD8, הצוות השתמש ב-TIMING כדי לעקוב אחר אינטראקציות בין תאי T בודדים ותאי גידול על פני אלפי תאים ושילב את התוצאות עם נתוני רצף RNA חד-תאיים.
קולטני אנטיגן כימריים (CAR) תאי T המשמשים לטיפול בגידולים ממאירים של תאי B יכולים לזהות תת-קבוצות של תאי T עם פעילות קלינית מעולה. תוך שימוש במוצרי עירוי של חולים עם לימפומה של תאי B גדולים, שילבנו פרופיל תפקודי באמצעות TIMING עם פרופיל תת-תאי ו-scRNA-seq כדי לזהות חתימה של תאי CD8 T רב-תכליתיים (CD8-fit). יצרנו פרופיל של תאים אלה באמצעות רצף RNA חד-תא כדי לזהות את החתימה המולקולרית התאמת CD8 שניתן להשתמש בה כדי לחזות תוצאות עמידות של מטופלים לטיפולים בתאי T ואימתנו את הממצאים שלנו עם מערכי נתונים עצמאיים.
עלי רזבן, מחבר ראשון
הצוות גם מצא שחתימת ההתאמה ל-CD8 קיימת בתאי T שיוצרו מראש, נמשכת לאורך זמן בחולים לאחר עירוי, והכי חשוב, קשורה לתגובות קליניות חיוביות ארוכות טווח. לדברי החוקרים, סביר להניח שתאי T אלה יכולים להניב תועלת קלינית בגידולים אחרים.
"עבודה זו ממחישה את המצוינות של הסטודנטים לתארים מתקדמים עלי רזוואן ומליסה מונטלבו; והחוקרים הפוסט-דוקטורנטים מליסה מרטינז-פניאגואה ואירפן בנדי בין היתר", אמר ורדרג'אן.
CellChorus, ספין-אוף ממעבדת תא יחיד של Varadarajan ב-UH, מפתחת את פלטפורמת TIMING המופעלת על ידי בינה מלאכותית. לאחרונה הודיעה החברה על מענק של 2.5 מיליון דולר למחקר חדשנות לעסקים קטנים מהמרכז הלאומי לקידום מדעי התרגום של המכונים הלאומיים לבריאות כדי לקדם את TIMING עבור יישומי טיפול תאי.
