הכריזה על פרסום מאמר חדש עבור חידושים ויישומים לב וכלי דם כְּתַב הָעֵת. מחקר זה נועד לבחון גנים הקשורים לחיסון ושינויי הביטוי שלהם באוטם שריר הלב (MI) באמצעות שיטות ביואינפורמטיקה מקיפות ומאמת גנים אלה כיעדים אבחוניים וטיפוליים פוטנציאליים.
נתוני ביטוי גנים נותחו משלושה מערכי נתונים: GSE29111 ו- GSE66360, ששולבו כמערכת אימונים, ו- GSE48060, ששימשו כמערכת האימות. ביצענו ניתוח ביטוי גנים דיפרנציאלי, ניתוח העשרה של GO/KEGG, ניתוח רשת חלבון-חלבון (PPI), ניתוח רשת משותף של גנים משוקללים (WGCNA), ניתוח העשרה של הגנים ומחקרי הסתננות חיסונית כדי לזהות גנים הקשורים לחיסון ליבה קשור ל- Mi. יכולות האבחון של גנים אלה הוערכו בעזרת עקומות מאפיינות מקלט, ו- RT-PCR שימש כדי לאמת את רמות הביטוי שלהם בין חולים עם MI וביקורת. מערכות היחסים של BCL6 עם התגובה הדלקתית והלחץ החמצוני נבדקו באמצעות איתור הגורמים הדלקתיים TNF-α, IL-1 ו- IL-6; יחידות משנה של NADPH Oxidase P67 ו- GP91; פעילות SOD; ותוכן מד"א.
זוהו תשעים ואחד גנים שבאו לידי ביטוי באופן דיפרנציאלי. ניתוחי העשרה הדגישו את מעורבותם בתגובה לליפופוליסכריד ומסלול האיתות IL-17. מרשת PPI של גנים אלה הוכרו תחילה ארבעה גנים ליבה, ו- WGCNA זיהו עוד 13 גנים. ניתוח צומת סיים את הזיהוי של S100A12 ו- BCL6 כסמנים ביולוגיים מרכזיים. שני הגנים הראו ביטוי דיפרנציאלי משמעותי בין MI לקבוצות הביקורת (P <0.01), עם AUCs אבחון של 0.809 ו- 0.837 בהתאמה. ממצאים אלה אושרו באימות שנקבע על ידי AUCs חיוביים באותה מידה. יתר על כן, ניתוח הסתננות חיסונית חשף מתאם חיובי בין גנים אלה לבין סמני תאים חיסוניים. לאחר דחיית BCL6 נצפתה תגובה דלקתית מחמירה ולחץ חמצוני, כפי שמצוין על ידי ביטוי גבוה יותר של גורמים דלקתיים ותת -יחידות אוקסידאז של NADPH, ופעילות SOD נמוכה יותר, בקבוצת MI מאשר בקבוצת הביקורת (P <0.01).
S100A12 ו- BCL6 עשויים לשמש כסמנים ביולוגיים של מועמדים לגילוי מוקדם של MI ולהבטיח כי יעדים טיפוליים חדשים.