בעוד שבדיקות טרום לידתיות לא פולשניות (NIPT) חוללו מהפכה באבחון טרום לידתי בכך שאפשרו לזהות מספר בעיות גנטיות בעובר, היא מוגבלת כיום ולכן היא מחמיצה גורמים גנטיים רבים להפרעות. אבל טכניקה חדשה, שתוצג היום (שבת) בכנס השנתי של האגודה האירופית לגנטיקה אנושית, מציגה טכנולוגיה הנקראת רצף עוברי לא פולשני (NIFS) שתסנן בו-זמנית כמעט 23,000 גנים, כמו גם את כל התנאים הנלכדים כיום על ידי NIPT, בהריונות עם או בלי עובר שזוהה בעבר.
בהצגה של המחקר, ד"ר כריסטופר ווילן, מדען חישובי בכיר שעובד במעבדתו של ד"ר מייקל טקובסקי במכון ברוד של המכון הטכנולוגי של מסצ'וסטס והרווארד, ובמרכז לרפואה גנומית בבית החולים הכללי של מסצ'וסטס, בוסטון, MA, ארה"ב, אומר שהטכניקה החדשה הצליחה לזהות שיעור גבוה מאוד מהווריאציות הגנטיות הרלוונטיות לקלינית, הניתנות לגילוי כרגע רק על ידי גנטיקה. הממצא מצביע על כך ש-NIFS עשוי לשמש ככלי בדיקה בטוח יותר ומדויק באותה מידה בכל ההריונות, הוא אומר.
רוב שיטות ה-NIPT העדכניות הן ברזולוציה נמוכה וממקדות רק מספר קטן של מומים גנטיים, וקיימת סטנדרטיזציה מוגבלת ביניהן. בדיקה מקיפה של כל הגנים הרלוונטיים לאבחון טרום לידתי נגישה רק באמצעות שיטות בדיקה פולשניות.
נכון לעכשיו, נשים רבות מסרבות לשיטות הרצף הפולשניות – בדיקת מי שפיר ודגימת דליות כוריוניות (CVS) – בגלל הסיכון לעובר, מתח קשור, קשיי גישה ועלות, למרות שיכולת האבחון שלו גבוהה. ניסינו לפתח בדיקה בעלת ערך אבחוני דומה, אך ללא הסיכונים ושאר החסרונות".
ד"ר כריסטופר ווילן, מדען חישוב בכיר
החוקרים בדקו NIFS על 565 הריונות בממוצע של 17 שבועות של הריון. הם יישמו רצף DNA עוברי ללא תאים עמוקים (cffDNA) לניתוח דגימות דם אימהיות, והשתמשו בשיטות מחשוב מתקדמות כדי לזהות וריאנטים גנטיים על פני כמעט 23,000 גנים (האקסום*) בכל עובר. בדיקת הממצאים שלהם מול אלו שמקורם ברצף ישיר של העובר בעקבות בדיקת מי שפיר או CVS אפשרה להם לאמת את דיוקם; הם גילו ש-NIFS זיהה כ-95-99% מהווריאציות הגנטיות שנמצאו בשיטות הפולשניות, בהתאם לסוג הווריאציה ודפוס התורשה, וחשוב מכך, 97.2% מהווריאציות הגנטיות האחראיות לתנאים חשובים מבחינה קלינית במחקר. "הבדיקה הצליחה מאוד בלכידת כל הווריאציות הרלוונטיות מבחינה קלינית שנמצאו על ידי GS פולשני שהיו מחמיצים בכל הבדיקות הלא פולשניות הנוכחיות, וגנוטיפ מדויק של למעלה מ-97% מהן. היו גם כמה תגליות בלתי צפויות, כגון הריונות תאומים עם רקמה לא תקינה, ועדויות לכך שחלק מהאמהות קיבלו השתלת מח עצם תורמת NIW מהן התוצאות של PT. "זה סיפק עדות נוספת לחוזקה של הטכניקה."
לפי ההערכות, NIFS זול משמעותית מתקן הזהב הנוכחי של GS פולשני, מכיוון שהוא בנוי במידה רבה על יכולות שכבר קיימות וזמינות באופן נרחב במעבדות אבחון מסחריות ואינו דורש הליך רפואי. הטכניקה משתמשת רק במספר מעט גדול יותר של קריאות רצף ממה שנדרש עבור GS פולשני, וניתן להשתמש בה בשלב מוקדם יותר בהריון מזה שבו ניתן לזהות את רוב הפרעות העובר באמצעות הדמיה. על ידי מתן גישה מוקדמת יותר למידע גנטי ולאבחנות, NIFS יכול להפחית את העלויות הכוללות על ידי מתן אפשרות לניהול מושכל יותר של הריון. הבדיקה כבר הוכחה כמדויקת בדגימות מהריונות כבר בשבוע ה-10 להריון, כאשר שיעור ה-cfDNA בדם האם מגיע מהשליה (החלק העובר) נמוך כשלושה אחוזים. "בשברים האלה, עדיין ראינו התאמה גבוהה מאוד עם GS קליני שבוצע על DNA מבדיקות פולשניות", אומר ד"ר Whelan.
החוקרים מתכוונים כעת להמשיך ולשפר את היכולות של NIFS כדי להיות מסוגלים לזהות וריאנטים גנטיים רלוונטיים קלינית נוספים שאינם מוערכים על ידי רצף אקסומים סטנדרטי. הם גם מרחיבים ומרחיבים את לימודיהם כדי לאפשר בדיקת NIFS לכל ההריונות בעתיד.
"למרות שהתשואות האבחוניות והביצועים הכוללים של הבדיקה לא היו הפתעה, זה היה מדהים שהצלחנו לגשת ולרצף כמה שיותר מהגנום העובר כפי שעשינו מתוך הוצאת דם אימהית פשוטה במהלך ההריון. בעתיד, יש הרבה עבודה מרגשת שקורה בתחום של טיפול טרום לידתי במחלה גנטית. יחד עם NIFS, זה יכול להיות יעיל יותר בשלב מוקדם יותר של NIFS ולאפשר NIFS יעיל יותר. גם מאפשר לנו להתחיל ללכוד, חודשים לפני הלידה, את המידע הרלוונטי מבחינה קלינית שמוערך כעת על ידי בדיקת תינוקות, מה שמאפשר הכנה מוקדמת לטיפול לאחר לידה", אומר ד"ר ווילן. "זהו שינוי פרדיגמה מרגש ונקודת הטיה לאבחון טרום לידתי."
יו"ר הכנס פרופסור אלכסנדר ריימונד, שלא היה מעורב במחקר, אמר: "ריצוף של כל הגנום של העובר מבלי לקבל אפילו דגימה מאותו העובר הוא סיור דה-כוח. זה פותח מיד הזדמנויות טיפול ומניעה ומשמעותו שרפואת הרבייה תשתנה לנצח".
