רקע ומטרות
כמוסות Shufeng Jiedu (SFJD), תכשיר לרפואה סינית מסורתית, נמצאות בשימוש נרחב בטיפול קליני בשפעת, אך מנגנון הפעולה שלהן עדיין לא ברור. מחקר זה נועד לחקור באופן שיטתי את המנגנון המולקולרי של SFJD בטיפול בשפעת באמצעות פרמקולוגיה רשתית וביואינפורמטיקה.
שיטות
החומרים הפעילים של SFJD אוחזרו ממאגרי מידע של רפואה סינית מסורתית, והמטרות שלהם זוהו באמצעות מסדי הנתונים Swiss Target Prediction ו-TCMSP. גנים של מחלת השפעת הושגו ממאגרי המידע GEO, GeneCards ו-DisGeNET, ודיאגרמת Venn שימשה לזיהוי מטרות פוטנציאליות על ידי מיפוי יעדי SFJD לגנים של מחלת השפעת. בניית רשת וניתוח של מטרות טיפוליות פוטנציאליות בוצעו באמצעות מסד הנתונים STRING12.0 ותוכנת Cytoscape3.9.1, מה שהוביל לזיהוי מטרות מפתח. הביטוי של מטרות טיפוליות פוטנציאליות ברקמות ובתאים אוחזר באמצעות מסד הנתונים של BioGPS. ניתוח העשרה פונקציונלי של מטרות אלו נערך באמצעות מסד הנתונים DAVID. לאחר מכן נעשה שימוש בעגינה מולקולרית כדי להעריך את האינטראקציות בין מטרות מפתח ומרכיבי ליבה פעילים.
תוצאות
SFJD מכיל 193 חומרים פעילים ו-985 מטרות. ישנם 510 גנים של מחלת השפעת, 97 מהם הינם מטרות טיפוליות פוטנציאליות עבור SFJD בטיפול בשפעת, עם 27 יעדי מפתח שזוהו באמצעות בניית רשת וניתוח. ניתוח ספציפי לרקמות/תא גילה ש-39 מטרות טיפוליות פוטנציאליות באות לידי ביטוי גבוה ב-37 רקמות/תאים ספציפיים. ניתוח העשרה תפקודית הדגיש מסלולים כגון מסלול איתות קולטן ללקטין מסוג C, מסלול איתות של גורם נמק של גידול ומסלול איתות של גורם 1 הניתן להיפוקסיה. תוצאות עגינה מולקולריות הצביעו על אינטראקציות חזקות בין מרכיבי הליבה הפעילים לבין המטרות העיקריות.
מסקנות
מחקר זה חושף באופן שיטתי כי מנגנון הפעולה של SFJD בטיפול בשפעת הוא מורכב, הכולל מטרות ומסלולים מרובים הקשורים להשפעות אנטי-ויראליות, אנטי דלקתיות וויסות חיסוני. הממצאים מספקים מידע התייחסות רב ערך לטיפול קליני עתידי ולמחקר בסיסי על שפעת.
