במחקר שפורסם לאחרונה בכתב העת גנומיקת תאים, צוות חוקרים בסין ערך מחקר מקרה-ביקורת כדי לנתח פאנל גדול של חלבוני סרום כדי לזהות סמנים ביולוגיים של חלבון לסרטן הלבלב. הם השתמשו בגישת רנדומיזציה מנדליאנית כדי להעריך את ההשפעות הסיבתיות הפוטנציאליות של חלבונים אלה בסרטן הלבלב.
מחקר: זיהוי של סמנים ביולוגיים ומטרות טיפוליות פוטנציאליות לסרטן הלבלב על ידי ניתוח פרוטאומי בשתי קבוצות פרוספקטיביות. קרדיט תמונה: סבסטיאן קאוליצקי / Shutterstock
רקע כללי
לסרטן הלבלב יש את התמותה השלישית בגובהה הקשורה לסרטן, כאשר במקרים של אבחון מאוחר יש שיעור הישרדות של חמש שנים של 10% בלבד. עם זאת, גילוי הסרטן בשלביו המוקדמים יכול להעלות את שיעורי ההישרדות בכמעט 24% עד 37%. בהתחשב בכך שסרטן הלבלב הוא גם צורה של סרטן שמתקדמת באיטיות, עם טווח ממוצע של 11.7 שנים בין השלב הראשוני והפולשני, יש מספיק זמן לגלות את הסרטן בשלבים המוקדמים.
סמנים ביולוגיים מסורתיים לסרטן, הכוללים את האנטיגן הקרצינואמבריוני ואנטיגנים הפחמימיים 19-9, 125 ו-242, הראו ספציפיות משתנה לסרטן הלבלב. חלבונים דלקתיים כמו גורם נמק של גידול (TNF), חלבון C-reactive (CRP) ואינטרלוקין-6 (IL-6) לא הראו גם קשר משמעותי עם סרטן לבלב.
ניתוח הפרוטאום בדם, המורכב מכל החלבונים במחזור המופרשים על ידי תאים ורקמות מתפקדים כרגיל, כמו גם אלו שניזוקו, היא שיטה מבטיחה לגילוי סוגי סרטן שכן סטיות בחלבונים במחזור מצביעות לרוב על התפתחות של נגעים וגידולים במחזור הדם. הגוף.
לגבי המחקר
במחקר הנוכחי, החוקרים חקרו קבוצה פרוספקטיבית כדי לזהות ולהעריך סמנים ביולוגיים של חלבון בסרום שיכולים לשמש לאיתור סרטן הלבלב. המשתתפים כללו 44 זוגות של קשישים עם סרטן הלבלב, והבקרות הבריאות שלהם הותאמו לפי גיל, מין, תאריך הוצאת דם ובית חולים. הגיל הממוצע של המשתתפים היה 68.48 שנים, ו-45% מאוכלוסיית המחקר היו גברים. נתוני המעקב עבור העוקבה נמשכו כ-5.7 שנים.
חלבונים במחזור נמדדו מדגימות סרום בצום באמצעות טכניקה המבוססת על בדיקת הרחבת קרבה. קרוב ל-1,500 חלבונים נמדדו וכומתו באמצעות Normalized Protein eXpression או ערך NPX. מאפיינים בסיסיים שונים כגון מצב עישון, רמות צריכת אלכוהול, רמות השכלה, מדדים גליקמיים ואינדקס מסת גוף הושוו בין מקרי סרטן הלבלב והתואמו בדיקות בריאות לזיהוי משתנים קטגוריים.
ערכי ביטוי החלבון היו סטנדרטיים, ויחס הסיכויים של כל חלבון חושב. בנוסף, נתוני החומצה הריבונוקלאית (RNA) שהתקבלו מפרויקט גנוטיפ-רקמות (GTEx) שימשו לבחינת פרופיל ביטוי הגנים של כל חלבון ב-54 רקמות. ניתוח רגישות נערך גם לאחר ריבוד הנתונים לפי מין והתאמה להופעת סוכרת מסוג 2.
מערך הנתונים של פלזמה proteomics שהושג מבריטניה (בריטניה) Biobank Pharma Proteomics Project (PPP) שימש עבור ניתוח שכפול עבור סמנים ביולוגיים של חלבון עיקריים. בנוסף, נעשה שימוש בגישת רנדומיזציה מנדלית משתי דגימות כדי להעריך השפעות סיבתיות פוטנציאליות שיכולות להיות לחלבונים שזוהו בסרטן הלבלב.
נתונים ממחקר לוקוס של תכונה כמותית בקנה מידה גדול של חלבונים ומחקרי אסוציאציות שונים ברחבי הגנום של סרטן הלבלב בקרב אוכלוסיות אירופאיות שימשו לניתוח האקראיות של מנדל.
תוצאות
המחקר זיהה ארבעה חלבונים – phospholipase A2 group IB (PLA2G1B), tumor necrosis factor (TNF) ובני משפחה מתחדשים (REG) 1A ו-1B – הקשורים לסרטן הלבלב. מתוכם, REG1A ו-REG1B שוכפלו באמצעות מערך הנתונים של Biobank PPP של בריטניה. יתרה מזאת, ניתוח האקראיות של מנדל באמצעות האסוציאציה הכוללת של הגנום ונתוני לוקוס של תכונה כמותית מצאה השפעות סיבתיות של REG1A ו-REG1B בסרטן הלבלב.
ניתוח קולוקליזציה עבור חלבוני REG1 מצא ראיות מתונות התומכות בסרטן הלבלב וחלבוני REG1 חולקים וריאנט סיבתי. יתר על כן, ניתוח האקראיות של מנדל לא מצא עדות לגרסאות סיבתיות אחרות המבלבלות את הקשר בין חלבוני REG1 לסרטן הלבלב.
כמו כן, נמצא כי חלבוני REG1 מוגברים באופן דומה עבור סרטן ריאות וסרטן הוושט. חלבונים אלו הם חלק ממשפחת החלבונים REG1 שנמצאו מקובצים בצוותא על הזרוע הקצרה של כרומוזום 2. חלבונים אלו מסונתזים בתאי ה-β של האיים של לנגרהנס בלבלב ומעורבים בהתפתחות סוכרת ובהתחדשות תאי איים.
החוקרים שיערו כי בהינתן תפקידם בתפקוד הלבלב, גידולים או נגעים בלבלב יעוררו את התפשטות תאי ה-β, מה שיוביל להפרשה חריגה של חלבוני REG1. יתר על כן, תחום הלקטין מסוג c שנמצא בחלבוני REG1 יכול גם להיקשר לפחמימות על משטחי תאי הגידול ולקדם צמיחה ממאירה.
מסקנות
לסיכום, החוקרים בחנו חלבונים במחזור כדי לזהות סמנים ביולוגיים פוטנציאליים לסרטן הלבלב. הממצאים דיווחו על שני חלבונים – REG1A ו-REG1B – שנמצאו כבעלי השפעות סיבתיות בסרטן הלבלב והיו מוגברים גם במקרים של סרטן הריאות והוושט. התוצאות מדגישות את הפוטנציאל של חלבוני REG1A ו-REG1B לשמש לגילוי מוקדם וסקר בקנה מידה גדול לסרטן הלבלב.
