כדי למנוע מטכנולוגיה גנומית מתפתחת לתרום לפערים בריאותיים, צוות מדעי הממומן על ידי המכון הלאומי לבריאות הגה דרכים חדשות לשיפור שיטת בדיקה גנטית הנקראת ציון סיכון פוליגני. מאחר שציוני הסיכון הפוליגני לא היו יעילים עבור כל האוכלוסיות, החוקרים כיילו מחדש את הבדיקות הגנטיות הללו תוך שימוש בנתונים גנומיים מגוונים של אבות. כפי שדווח ב רפואת טבעהבדיקות האופטימליות מספקות הערכה מדויקת יותר של הסיכון למחלה על פני אוכלוסיות מגוונות.
בדיקות גנטיות בוחנות את ההבדלים הקטנים בין הגנום של אנשים, המכונה וריאנטים גנומיים, וציוני סיכון פוליגניים הם כלים להערכת וריאנטים גנומיים רבים ברחבי הגנום כדי לקבוע את הסיכון של אדם למחלה. ככל שהשימוש בציוני סיכון פוליגני הולך וגדל, דאגה מרכזית אחת היא שמערכי הנתונים הגנומיים המשמשים לחישוב הציונים מייצגים לעתים קרובות יותר מדי אנשים ממוצא אירופי.
לאחרונה, יותר ויותר מחקרים משלבים נתונים גנומיים מרובי מוצא בפיתוח ציוני סיכון פוליגניים. עם זאת, עדיין קיימים פערים בייצוג אבותי גנטי בציונים רבים שפותחו עד היום".
ניאל לנון, Ph.D., מדען במכון ברוד בקיימברידג', מסצ'וסטס והמחבר הראשון של הפרסום
"פערים" אלה או נתונים חסרים יכולים לגרום לתוצאות שגויות, שבהן אדם עלול להיות בסיכון גבוה למחלה אך לא לקבל ציון בסיכון גבוה מכיוון שהווריאציות הגנומיות שלו אינן מיוצגות. למרות שהפערים הבריאותיים נובעים לרוב מאפליה מערכתית, לא מגנטיקה, תוצאות כוזבות אלו הן דרך שכלים גנטיים לא שוויוניים יכולים להחמיר את הפערים הבריאותיים הקיימים.
במחקר החדש, החוקרים שיפרו את ציוני הסיכון הפוליגניים הקיימים באמצעות רישומי בריאות ונתונים גנומיים מגוונים אבותיים מה- כולנו תוכנית המחקר, יוזמה במימון NIH לאיסוף נתוני בריאות מלמעלה ממיליון אנשים מרקעים מגוונים.
ה כולנו מערך הנתונים ייצג בערך פי שלושה פרטים ממוצא לא-אירופי בהשוואה למערכי נתונים עיקריים אחרים ששימשו בעבר לחישוב ציוני סיכון פוליגניים. זה גם כלל פי שמונה פרטים רבים עם מוצא המשתרע על פני שתי אוכלוסיות עולמיות או יותר. ייצוג חזק של אנשים אלה הוא המפתח מכיוון שהם נוטים יותר מקבוצות אחרות לקבל תוצאות מטעות מציוני סיכון פוליגניים.
החוקרים בחרו ציוני סיכון פוליגני עבור 10 מצבים בריאותיים נפוצים, כולל סרטן השד, סרטן הערמונית, מחלת כליות כרונית, מחלת לב כלילית, אסטמה וסוכרת. ציוני סיכון פוליגניים שימושיים במיוחד להערכת סיכון למצבים הנובעים משילוב של מספר גורמים גנטיים, כמו במקרה של 10 המצבים שנבחרו. רבים ממצבי הבריאות הללו קשורים גם לפערים בריאותיים.
החוקרים הרכיבו קבוצות אבות מגוונות מה- כולנו נתונים, כולל אנשים עם וללא כל מחלה. הווריאציות הגנומיות המיוצגות בקבוצות אלה אפשרו לחוקרים לכייל מחדש את ציוני הסיכון הפוליגני עבור אנשים ממוצא לא-אירופי.
עם הציונים האופטימליים, החוקרים ניתחו את הסיכון למחלה עבור קבוצה מגוונת אבות של 2,500 פרטים. כ-1 מכל 5 משתתפים נמצא בסיכון גבוה לפחות לאחת מ-10 המחלות.
והכי חשוב, המשתתפים הללו היו במגוון רחב של הרקע האבותי שלהם, והראו שציוני הסיכון הפוליגניים המכוילים מחדש אינם מוטים כלפי אנשים ממוצא אירופי והם יעילים עבור כל האוכלוסיות.
"המודל שלנו מגדיל מאוד את הסבירות שאדם בקצה הסיכון הגבוה של ההפצה יקבל תוצאה בסיכון גבוה ללא קשר למוצאו הגנטי", אמר ד"ר לנון. "המגוון של כולנו מערך הנתונים היה קריטי ליכולתנו לעשות זאת."
עם זאת, ציונים אופטימליים אלה אינם יכולים להתמודד עם פערי בריאות לבד. "תוצאות ציון הסיכון הפוליגני מועילות רק לחולים שיכולים לנקוט בפעולה כדי למנוע מחלה או להידבק בה מוקדם, ואנשים עם פחות גישה לטיפול רפואי יתקשו גם לקבל את פעילויות המעקב המומלצות, כגון בדיקות תכופות יותר", אמר ד"ר. לנון.
ובכל זאת, עבודה זו היא צעד חשוב לקראת שימוש שגרתי בציוני סיכון פוליגני במרפאה לטובת כל האנשים. 2,500 המשתתפים במחקר זה מייצגים רק מבט ראשוני על ציוני הסיכון הפוליגני המשופרים. רשת רשומות הבריאות והגנומיקה האלקטרונית של NIH (eMERGE) תמשיך במחקר זה על ידי רישום סך של 25,000 משתתפים מאוכלוסיות מגוונות ממוצא אבות לשלב הבא של המחקר.
