הכריזה על פרסום מאמר חדש עבור זונוזות כְּתַב הָעֵת. מחקר זה נועד לנתח את המאפיינים הפתוגניים של Bordetella Hinzii ((ב. הינזי), והבהרת מנגנוני ההתנגדות לאנטיביוטיקה, חלוקת גנים של נגיף ופוטנציאל התפתחות חיסונים.
גנומים של 38 זנים גלובליים הורדו ממסד הנתונים של NCBI. לאחר בקרת איכות עם CheckM, בוצעה ניתוח פן-גנום באמצעות ROARY, נבנו עצים פילוגנטיים מבוססי SNP עם גנים עמידות לאנטיביוטיקה (מסד נתונים בכרטיס) וגנים נגיפים (מסד נתונים VFDB) עם ביטול. כלי ביואינפורמטיקה שולבו לחלבוני חיסון למועמדים.
כל הזנים נשאו גנים התנגדות מהותיים, כולל משאבות שפכים (Mexab-oprm) וה- β-lactamase HBL-1שהעניקו התנגדות לעשרה שיעורים אנטיביוטיים. גנים של נגיף ליבה (BPLA-L– BVGASוגנים הקשורים לפללה) היו שמורים מאוד (שיעור הגילוי> 92.1%). ניתוח SNP סיווג את הזנים לשישה קליידות, ובודדים הנגזרים מבני אדם הראו אשכולות ספציפיים למארח. הגנום הפאן היה פתוח (7,530 גנים; פרמטר משפט הערימות ב = 0.35). שני חלבוני קרום חיצוניים, LPTD ו- BAMD, זוהו כמועמדים לחיסונים (ציוני אנטיגניות> 0.4; אין הומולוגיה מארחת).
ב. הינזי מציג סיכוני שידור חוצה מארח, מונע על ידי גנים נגיפים שמורים וגנום פתוח המאפשר התפתחות אדפטיבית. LPTD ו- BAMD מייצגים יעדי חיסון פוטנציאליים הדורשים אימות נוסף. מחקר זה מספק בסיס תיאורטי לאסטרטגיות ניהול ומניעה קליניות.
