נגיף שפעת העופות A(H5N1), שהתפשט לבהמות והדביק 14 אנשים השנה, זוהה באמצעות רצף וירומים בשפכים של 10 ערים בטקסס על ידי חוקרים ב-UTHealth Houston ו-Baylor College of Medicine. הווירום הוא אוסף הנגיפים בדגימה, במקרה זה דגימת שפכים.
המידע פורסם ב- New England Journal of Medicine.
עד מרץ 2024, H5N1 לא זוהה ב-1,337 דגימות שפכים שנותחו על ידי הצוות. אבל מ-4 במרץ עד 15 ביולי (סוף איסוף הנתונים עבור מאמר זה), H5N1 זוהה ב-10 מתוך 10 ערים, 22 מתוך 23 אתרים ו-100 מתוך 399 דגימות. עם זאת, השפע של H5N1 בדגימות שפכים שנאספו לאורך זמן לא היה בקורלציה עם אשפוזים הקשורים לשפעת באותה תקופה, כך שהסיכון לציבור היה נמוך ביותר.
UTHealth יוסטון וביילור הקימו את תוכנית בדיקת מי השפכים כחלק מהמכון לבריאות הציבור של מגפת טקסס (TEPHI).
פרוטוקול הרצף המשמש את הצוות יכול לזהות שינויים גנטיים שעשויים להצביע על הסתגלות של הנגיף ליונקים, אולי אפילו לבני אדם. היעדר עומס קליני בבני אדם ומידע גנומי הצביעו על כך שמקור עומס הנגיפים שנמצא בשפכים במהלך פרק הזמן הזה הגיע ממקורות בעלי חיים. אבל המשך המעקב הוא קריטי לניטור כל התאמות אבולוציוניות שיצביעו על הפוטנציאל לקפוץ לבני אדם, סיכמו החוקרים.
המחברים הראשיים של מכתב כתב העת היו מייקל ג'יי טיסה, דוקטורט, עוזר פרופסור לווירולוגיה מולקולרית ומיקרוביולוגיה ב- Baylor; בלייק הנסון, PhD, עוזר פרופסור במרכז למחלות זיהומיות בבית הספר לבריאות הציבור של UTHealth Houston; אריק בורווינקל, דוקטור, מנהל TEPHI והדיקן, יו"ר משפחת קוזמצקי לגנטיקה אנושית, ויו"ר M. David Low לבריאות הציבור של בית הספר לבריאות הציבור; ו-Anthony W. Maresso, PhD, יו"ר ג'וזף ל. מלניק לענייני וירולוגיה ב-Baylor. בורווינקל והנסון הם גם חברים באוניברסיטת טקסס MD Anderson Cancer Center UTHealth Houston Graduate School of Biomedical Sciences.
הצוות מזהה וירוסים במי שפכים באמצעות ערכת לכידת בדיקה ויראלית המכוונת לאלפי מינים או גרסאות ויראליות. מאז מאי 2022, TEPHI זיהה יותר מ-400 וירוסים של בני אדם ובעלי חיים, כמה מהם (SARS-CoV-2, שפעת ו-mpox) תואמים לנתוני מקרים קליניים באוכלוסייה.
מחברי המכתבים מ- UTHealth יוסטון כללו את Kristina Mena, PhD, הקתדרה להגנת בריאות הסביבה של ג'יין דייל אוון; אנה גיטר, דוקטורט; Fuqing Wu, PhD; ג'אנל ריוס, MPH, PhD; וג'ניפר דיגן, MPAff. ממכללת ביילור לרפואה: ג'סטין קלארק, דוקטור; לי וואנג, MD, PhD; Katelyn Payne, BS, Matthew Ross, PhD; שרה ג'בורניק קרגין, דוקטורט; Juwan Cormier, PhD; Vasanthi Avadhanula, PhD; Austen Terwilliger, PhD; פדרו פידרה, MD; ג'וזף פטרוזינו, דוקטורט. ג'ון באלייו, עם שירות המים של אל פאסו, היה גם מחבר שותף.
