החוקרים הדגימו את היתכנותה של גישה מבוססת מורפולוגית לפרשנות נתוני טרנסקריפטומי מרחבי (ST), וסייעו בשיפור ההבנה של הנגעים המתרחשים במחלות כליות כרוניות (CKD), הן ברמות התא והן במולקולריות. מחקר שנערך לאחרונה ב- כתב העת האמריקני לפתולוגיהשפורסם על ידי Elsevier, מפרט כיצד שיטה חדשה זו יכולה להוביל לזיהוי של סמנים ביולוגיים חדשים ואסטרטגיות טיפוליות לחולים.
טכנולוגיות ST הן כלי חדש המתפתח במהירות למדידת RNA בהקשר המרחבי המקורי שלהן, ומעניקים מימד מכניסטי מולקולרי למורפולוגיה של רקמות. היישום של ST Technologies כבר הניב תובנות חשובות על רקמות רבות ומודלים של מחלות. על ידי שילוב של פרופיל של דפוסי ביטוי גנים עם המידע המרחבי של תאים ברקמות, ST מספק הבנה מלאה יותר של הארגון המולקולרי והתאי של רקמות ונגעים.
החוקר הראשי בנימין ד. האמפריס, ד"ר דוקטורט, אגף הנפרולוגיה, המחלקה לרפואה והמחלקה לביולוגיה התפתחותית, אוניברסיטת וושינגטון בסנט לואיס, מסבירה"במהלך ניתוח נתוני ST, לעתים קרובות מוצבים אשכולות המנותקים חישוביים על דימוי היסטולוגי. עם זאת, מורפולוגיה של רקמות על ידי הערכה פתולוגית מיקרוסקופית אור סטנדרטית לא נחשבת. הדבר עשוי למנוע הטמעה של מידע חשוב שיכול לעזור לפרש את נתוני ה- ST. הכליה הוא איבר הטרוגני במיוחד במונחים מורפולוגיים, עם מידה גבוהה של שונות נגע מרחבית וזמנית שנמצאת לעתים קרובות במצבים פתולוגיים ניתוח מבוסס היסטופתולוגי של טרנסקריפטומיקה מרחבית על ארבע דגימות כליות אנושיות עם CKD, המתאים ככל האפשר לאופן בו מתפרשת ביופסיה של כליות בפרקטיקה הקלינית. "
המחקר מדגים כיצד:
- אנליזה מורפולוגית ו- ST יכולה לעזור בזיהוי נגעים ברקמות כמו איברי לימפואיד שלישוניים בכליה.
- ניתן לקבוע את ההרכב הסלולרי של נגע ספציפי, לעיתים מעבר למראה המורפולוגי שלו, כמו במקרה של גידול הפפילרי שזוהה.
- ניתן לזהות את המנגנונים המולקולריים של תהליכי הנגע על ידי השוואה בין נגעים בשלבים שונים, כמו במקרה של פיברוזיס גלומרולרי או אטרופיה צינורית.
- לזהות גנים חדשים פוטנציאליים כמו CXCL12 אוֹ FXYD5 זה עשוי להיות מעורב בפיברוזיס גלומרולרי.
- שיטה זו המשלבת היסטופתולוגיה מסורתית עם נתוני ST יכולה לסלול את הדרך לעתיד המיקרוסקופיה המולקולרית ופתולוגיה מדויקת.
הסופר הראשי פייר איסנארד, ד"ר דוקטורט, אגף הנפרולוגיה, המחלקה לרפואה והמחלקה לביולוגיה התפתחותית, אוניברסיטת וושינגטון בסנט לואיס, מסכמת, מסכמת, "ST Technologies הן חדשות ומשמשות יותר ויותר במדעי החיים, אך יש חוסר במחקרים המראים את היתרונות והיישומים שלהם. כאן אנו מדגימים את האופי המשלים של טכנולוגיות אלה לניתוח מורפולוגי סטנדרטי של רקמות לצורך זיהוי, סיווג והבנת נגעים . סמנים ביולוגיים ו/או אסטרטגיות טיפוליות לחולים. "
