מחקר חדש בראשות קינגס קולג' בלונדון, בשיתוף אוניברסיטת וסטמינסטר, שופך אור על המגוון והמאפיינים של E. coli זנים המניעים זיהומים בכף הרגל הסוכרתית.
פורסם ב ספקטרום מיקרוביולוגיההמחקר מספק את האפיון הגנומי המקיף הראשון של E. coli זנים מבודדים ישירות מכיבים סוכרתיים בכף הרגל על פני מספר יבשות. הממצאים יכולים לעזור להסביר מדוע זיהומים מסוימים הופכים קשים במיוחד לטיפול ומדוע הם יכולים להוביל לתוצאות חמורות, לפעמים מסכנות חיים.
זיהומים בכף הרגל הסוכרתית נותרו אחד הסיבוכים החמורים ביותר של סוכרת ומהווים גורם מוביל לכריתת גפיים תחתונות ברחבי העולם. למרות שרופאים זיהו שזיהומי פצע כרוני אלה הם לעתים קרובות מורכבים, מעט ידוע על הפתוגנים הספציפיים המעורבים, במיוחד E. coliלמרות גילויו התכוף בדגימות קליניות.
חוקרים ניתחו רצפים של גנום שלם מ-42 E. coli זנים מבודדים מכיבים נגועים בכף הרגל הסוכרתית בחולים ברחבי ניגריה, בריטניה, גאנה, שוודיה, מלזיה, סין, דרום קוריאה, ברזיל, הודו וארה"ב. על ידי רצף ה-DNA המלא של כל זן חיידקי, הצוות הצליח לבחון דפוסים גלובליים בביולוגיה של E. coli קשור למחלת כף רגל סוכרתית. גישה זו אפשרה לחוקרים להשוות הבדלים גנטיים בין זנים, לזהות גנים הקשורים לעמידות לאנטיביוטיקה, ולאתר גורמים התורמים לחומרת המחלה.
הניתוח הגנומי הראה כי E. coli הזנים היו מגוונים מאוד. החיידקים השתייכו לקבוצות גנטיות רבות ושונות ונשאו מגוון רחב של גנים הקשורים לעמידות לאנטיביוטיקה ולמחלות. זה מוכיח שאין סוג אחד של E. coli אחראי לזיהומים בכף הרגל הסוכרתית, ושושלות נפרדות היו מסוגלות באופן עצמאי להסתגל לסביבת כף הרגל הסוכרתית.
על ידי ניתוח האופן שבו הזנים קשורים וזיהוי מנגנוני ההתנגדות ותכונות הארסיות (התכונות או הכלים שהופכים חיידק מזיק יותר) שהם נושאים, המחקר עוזר להסביר מדוע דלקות כף רגל סוכרתיות מסוימות קשות במיוחד לטיפול או יכולות להתקדם במהירות למחלה קשה.
יש לציין כי כ-8% מהזנים סווגו כעמידים לריבוי תרופות או עמידים לתרופות באופן נרחב, כלומר הם עמידים למספר רב של או כמעט לכל האנטיביוטיקה הזמינה.
הבנת החיידקים הללו ברמה הגנומית היא צעד מכריע לקראת שיפור האבחון ואפשר טיפולים ממוקדים יותר לאנשים עם סוכרת. על ידי זיהוי איזה E. coli הזנים הנפוצים ביותר ולאילו אנטיביוטיקה הם צפויים להתנגד, רופאים יכולים לבחור טיפולים בעלי סבירות גבוהה יותר לעבוד, לעזור להפחית זיהום ממושך, אשפוז והסיכון לקטיעה".
ד"ר וינצ'נזו טורקה, מרצה למחלות זיהומיות בקינגס קולג' בלונדון ומחבר בכיר של המאמר
ויקטור אג'ומיבי, דוקטורנט שנה שנייה בקינגס קולג' בלונדון ובאוניברסיטת וסטמינסטר, והמחבר הראשון של המאמר, הוסיף: "מידע זה יהיה בעל ערך במיוחד במסגרות של משאבים נמוכים, שבהם E. coli זיהומים של כיבים סוכרתיים בכף הרגל שכיחים יותר ושהם לא תמיד זמינים כלים לאבחון מהיר לעמידות לאנטי-מיקרוביאלית".
מחקר עתידי יתמקד בהבנה כיצד גורמי ארסיות ספציפיים שזוהו במחקר תורמים להתקדמות המחלה. רבים מהמבודדים נושאים גנים המאפשרים E. coli להיצמד לרקמות המארחות או להתחמק ממערכת החיסון. חקירת האופן שבו תכונות אלו פועלות בסביבת כף הרגל הסוכרתית עשויה לחשוף מטרות טיפוליות חדשות ולתמוך בפיתוח אסטרטגיות טיפול משופרות.
