מדענים מבית החולים לחקר הילדים של סנט ג'וד, מכון הילדים של סיאטל וקבוצת הילדים האונקולוגית (COG) זיהו שינויים גנטיים חדשים המשפיעים על הסיכון להישנות בילדים עם לוקמיה לימפובלסטית חריפה בתאי B בסיכון סטנדרטי (SR B-ALL), הילדות השכיחה ביותר. סַרְטָן. הזיהוי של מנבאים גנומיים של הישנות ב-SR B-ALL מספק בסיס לאבחון משופר, התאמה מדויקת של עוצמת הטיפול ופוטנציאל לפיתוח גישות טיפול חדשות. המחקר פורסם היום ב- כתב עת לאונקולוגיה קלינית.
לסיכון סטנדרטי ל-ALL יש פרוגנוזה מצוינת, עם שיעורי הפוגה של מעל 90%. עם זאת, כ-15% מהחולים המשיגים הפוגה מאוחר יותר חווים הישנות. מחקרים קודמים שבדקו שינויים גנומיים כדי לחזות את הסיכון להישנות התמקדו בעיקר בתתי קבוצות של ALL בסיכון גבוה. SR B-ALL מייצג קבוצה גדולה יותר של חולים ומהווה בערך מחצית מהילדים עם ALL שחזרו. מחקר זה הוא אחד הראשונים שבדקו באופן שיטתי גורמים גנטיים בקנה מידה גדול המשפיעים על הסיכון להישנות ב-SR B-ALL.
ALL, כסרטן הילדות הנפוץ ביותר, הוא סיפור הצלחה גדול עם למעלה מ-90% מהילדים שנרפאו. אבל נותרה אוכלוסייה של ילדים שמחלתם לא נרפאה במלואה, ולא הבנו לגמרי למה זה המצב. מחקר זה התמקד באותה קבוצה של מקרים לא מובנים, שבהם אנו יודעים פחות על התכונות המשפיעות על הסיכון שהטיפול לא יעבוד והמחלה חוזרת".
צ'ארלס מאליגן, MBBS (הצטיינות), MSc, MD, סגן מנהל מרכז הסרטן המקיף סנט ג'וד וחבר המחלקה לפתולוגיה, מחבר בכיר שותף
זיהוי וריאציות גנטיות המווסתות סיכון
פרופיל גנומי מזהה שינויים גנטיים ספציפיים הקשורים לרגישות לסרטן, סיכון להישנות וכיצד גידולים מגיבים לטיפולים. מחקרים אלו מאפשרים למדענים ולקלינאים לחזות כיצד סביר להניח שהמטופלים יגיבו לטיפול, ומספקים תובנות המעצבות את הטיפול ב-ALL בילדות. תוצאות ממחקר שיתופי זה מדגימות את החשיבות של פרופיל גנומי בקביעה מדויקת של סיכון המטופל ב-B-ALL, בשילוב עם קריטריונים מסורתיים.
"אנחנו מתכננים לצמצם את הטיפולים הקונבנציונליים בעתיד לילדים עם ALL כי אנחנו יודעים שניתן לרפא חולים רבים עם פחות טיפול", הסביר מחבר בכיר, Mignon Loh, MD, מנהיג מרכז הסרטן וההפרעות בדם בסיאטל. יו"ר ועדת COG ALL, אמריטוס, מנהל מרכז בן טאון לילדים בסיאטל לחקר סרטן בילדות, וראש חטיבת הילדים של סיאטל להמטולוגיה ילדים, אונקולוגיה, השתלות מח עצם וטיפול תאי. "אנחנו רוצים לוודא שאנחנו מזהים במדויק את אותם ילדים, ובגלל העיצוב המיוחד של המחקר, הפרויקט הזה אפשר לנו לעשות בדיוק את זה".
המדענים ערכו רצף גנום ותעתיק הן בדגימות SR B-ALL שחזרו והן בדגימות שנותרו בהפוגה מוחלטת ביחס של אחד: שתיים. הם מצאו כי כל תת-הסוגים, השינויים הגנטיים ודפוסי האנופלואידיה (תוספת או חסרים של כרומוזומים) היו קשורים לסיכון להישנות ולזמן להישנות. כמה תת-סוגים של B-ALL, כגון היפר-דיפלואיד ו ETV6::RUNX1 ALL, היו עם תדירות נמוכה של הישנות, אבל אחרים כולל PAX5-שונה, TCF3/4::HLF, דמוי ETV6::RUNX1 ו BCR::ABL1 דמוי היו קשורים לסיכון מוגבר להישנות. יש לציין שהסוג הספציפי של שינויים גנטיים בתוך אותם תת-סוגים B-ALL השפיע עוד יותר על הסיכון להישנות. עבודה זו הדגימה כי שינויים גנטיים ותתי סוגים של סרטן משפיעים על הסיכון להישנות ב-SR B-ALL, ולמטופלים המסווגים כבעלי סיכון סטנדרטי יכולים להיות גידולים בעלי תכונות בסיכון גבוה.
"ריצוף גנום שלם היה חשוב כדי לזהות בצורה מדויקת ומקיפה את השינויים הללו, ולא ניתן היה לזהות את כולם בלעדיו", הסביר מוליגן. "ילדים עם SR ALL צריכים לרצף את הגנום של תאי הגידול שלהם עם האבחנה הראשונית שלהם כדי לזהות אם לתאי הגידול שלהם יש תכונות בסיכון גבוה, כך שניתן יהיה להגביר את עוצמת הטיפול הראשונית שלהם."
"מעבר לטיפולים קונבנציונליים, מידע זה יכול לשמש גם כדי לפתח ולחקור אסטרטגיות טיפול חדשות, מותאמות אישית", הוסיף לו.
מחברים ומימון
המחברים הראשונים של המחקר הם טי-צ'נג צ'אנג ווינאן צ'ן מסנט ג'וד.
המחברים האחרים של המחקר הם מרי שאגו, אוניברסיטת טורונטו; קארן רבין, מכללת ביילור לרפואה; אליזבת ראץ, וויליאם קרול, מרכז הסרטן פרלמוטר; אן אנגיולילו, המרכז הלאומי לרפואה לילדים; מייקל בורוביץ, אוניברסיטת ג'ון הופקינס; מייקל בורק, המכללה הרפואית של ויסקונסין; אנדרו קרול, אוניברסיטת אלבמה בבירמינגהם; אי-מינג צ'ן, ריצ'רד הארווי; אוניברסיטת ניו מקסיקו, אלבקרקי; ניילה Heerema, אוניברסיטת אוהיו סטייט; ג'רמי וואנג, אוניברסיטת צפון קרוליינה בצ'פל היל; אריק לארסן, תוכנית הסרטן לילדים במיין; לאונרד מתאנו, HARP Pharma Consulting; קלי מלוני, אוניברסיטת קולורדו; נילסה רמירז, בית חולים ארצי לילדים ואוניברסיטת אוהיו סטייט; וונדה זלצר, אוניברסיטת שירותי מדים; שריל ווילמן, מאיו קליניק; נעמי ויניק, המרכז הרפואי הדרום-מערבי של אוניברסיטת טקסס; ברנט ווד, אוניברסיטת דרום קליפורניה; סטיבן הונגר, בית החולים לילדים בפילדלפיה ואוניברסיטת פנסילבניה; ו-Chunxu Qu, Zhongshan Chen, Dale Hedges, Abdelrahman Elsayed, Stanley Pounds, Meenakshi Devidas, Cheng Cheng, Pradyuamma Baviskar, Ilaria Iacobucci, Sima Jeha, Ching-Hon Pui, and Gang Wu, St. Jude.
המחקר נתמך על ידי המכונים הלאומיים לבריאות (R35 CA197695 ו-CA21765), Cancer Moonshot (HHSN261201500003I) ו-ALSAC, ארגון המודעות לגיוס כספים של St. Jude.