ההתקדמות המהירה של בינה מלאכותית (AI) הופכת את תחום הביולוגיה המבנית. במאי 2024, מעבדות Deepmind ו- Isomorphic השיקו את Alphafold 3 (AF3), מערכת AI מהפכנית המסוגלת לחזות את מבני התלת מימד ואת האינטראקציות של חלבונים, חומצות גרעין, מולקולות קטנות, יונים וביומולקוליות אחרות עם דיוק מדהים.
שלא כמו קודמותיה, AF3 משתמשת בארכיטקטורה מבוססת דיפוזיה חדשה המאפשרת לה לדגמן מערכות מולקולריות מורכבות מעבר לחלבונים בודדים. זה משיג דיוק גבוה יותר באופן משמעותי בחיזוי קומפלקסים של חומצה חלבונית-ליגנד חלבון, חלבון גרעיני ומתחמי רב-רכיבים-ביצוע כלים חישוביים מסורתיים ואפילו תוכנת עגינה מיוחדת.
AF3 כבר הפגין פוטנציאל רב על פני מספר תחומים:
- עיצוב סמים: היא מנבאת במדויק אתרי קשירה ואנרגיות אינטראקציה, ומאיץ את זיהוי היעד ואופטימיזציה של תרופות.
- פיתוח חיסונים: AF3 מדגמים אינטראקציות נגד נוגדנים-נוגדנים, המסייעים בתכנון של חיסונים יעילים יותר.
- מנגנוני מחלה: החוקרים משתמשים ב- AF3 כדי לחקור שינויים בקונפורמציה של חלבון הקשורים למחלות כמו אלצהיימר וסרטן.
- הנדסת חלבונים: הכלי תומך בעיצוב חלבונים ואנזימים חדשים עם פונקציות מותאמות.
למרות נקודות החוזק שלה, AF3 עדיין עומד בפני אתגרים, כמו חיזוי שינויים בקונפורמציה דינאמית והימנעות מ"הזיות "באזורי חלבון מופרעים. עם זאת, שחרורו של הקוד הפתוח והשיפורים המתמשכים מבטיחים לשפר עוד יותר את יכולותיה.
העבודה, שכותרתה "Alphafold 3: הזדמנות לא נכונה למחקר בסיסי ופיתוח תרופות", פורסמה ב רפואה קלינית מדויקת ב -1 ביולי 2025.
