ביטול נעילת הידע על אוסף הנגיפים העצום והמגוון של גופנו ובגופנו הוא המטרה של מענק של 20 מיליון דולר מהקרן המשותפת של המוסדות הלאומיים לבריאות (NIH) לחוקרים, כולל צוות ב- Uthealth Houston.
סוזן פישר-הוש, ד"ר, פרופסור לאפידמיולוגיה בבית הספר לבריאות הציבור של Uthealth Houston בבראונסוויל, הוא אחד מארבעה חוקרים עיקריים. היא תשתף פעולה עם חוקרים עמיתים במרכז הרפואי של המוסד הראשי ונדרבילט ובאוניברסיטת צפון קרוליינה בצ'אפל היל. המימון ייצר את מרכז אפיון הנגיף המתואם Vanderbilt.
במסגרת תוכנית הווירום האנושי, שהושקה בשנה שעברה על ידי הקרן המשותפת של NIH, NIH צופה לממן חמישה מרכזי מחקר המבקשים לאפיין את הווירום האנושי לאורך תוחלת החיים באמצעות קבוצות מחקר מגוונות ואורכיות ברחבי ארה"ב המחקר הקיים התמקד במספר הקטן של הנגיפים הגורמים למחלה. המרכזים יחקרו את הנגיפים הרבים האחרים המוכשרים המרכיבים וירום אנושי בריא ואינם קשורים למחלה ידועה או פתאומית.
אחת הקבוצות בתוכנית היא הקבוצה ההיספנית של מחוז קמרון (CCHC), שהוקמה לפני למעלה מעשרים שנה על ידי פישר-הו וג'וזף מקורמיק, ד"ר ג'יימס ג'יי סטיל, פרופסור DVM בבית הספר לבריאות הציבור בברונסוויל, שנמצא בגבול טקסס-מקסיקו. ל- CCHC יש כיום יותר מ -5,000 משתתפים בגילאי 8-90 ממשקי בית היספניים/לטינו בעלי הכנסה נמוכה. פרויקט הוויראום יכלול אנשים בריאים: 1,750 עם דגימות ביולוגיות בארכיון שנמשכות עד שני עשורים, ו -500 שיספקו דגימות פוטנציאליות במשך כארבע שנים.
"זה כבוד גדול עבורנו בבית הספר לבריאות הציבור בבראונסוויל ובאוניברסיטה כולה", אמר פישר-הו, שצוותו קיבל מימון של 5 מיליון דולר. "הרמה הגבוהה של פנוטיפים והפלטפורמה הרב-אומית של הקבוצה שלנו תספק יכולת יוצאת דופן לאתר השפעה על ידי וירוסים על בריאות האדם ומחלות. אנו רוצים גם להכיר במשתתפי הקבוצה מהקהילה שלנו שעבדו איתנו בנדיבות כדי להשיג הפרס הזה.
רב-אומיקס מתייחס לשילוב מחקרי של נתונים מ"אומיקס "שונים, אשר יחד תורמים למנגנונים המולקולריים של בריאות ומחלות, כמו גנומיקה, אפיגנומיקה, טרנסקריפטומיקה, פרוטאומיקה ומטבולומיקה. בית הספר לבריאות הציבור בבראונסוויל נבחר כאחד משש אתרים של ה- Multi-Mumics של ה- NIH לבריאות ומחלות קונסורציום.
הקבוצה הנוספת הכלולה במרכז אפיון הנגיף המתואם בוונדרבילט היא האלרגיה לילדות של המרכז הרפואי באוניברסיטת ונדרבילט והסביבה הילודים – וירוסים קבוצת המחקר, מחקר המורכב מכ -200 ילדים שאחריו מלידה עד גיל 5.
מרכז אפיון הנגיף המתואם של ונדרבילט יעבוד בשיתוף עם צוותי מחקר במוסדות אחרים במטרה לחשוף את האינטראקציות בין המארח האנושי לווירום ולפתח כלים, מודלים ושיטות לתפוס ולתאר את הווירום האנושי.
נגיפים אנושיים מובנים ברובם, כאשר מרבית המחקרים מתמקדים באופן היסטורי רק בנגיפים פתוגניים הגורמים למחלה קלינית ברורה, ואילו הרוב המכריע של הנגיפים השוכנים בנו מבלי לגרום למחלות נותרו לא טובות. "
סומאן דאס, דוקטור
DAS משמש גם כמוביל המינהלי למענק חמש שנים.
שני החוקרים האחרים המובילים הם הקרדיולוג רבי שאה, מרפאה, פרופסור לרפואה במרכז הרפואי באוניברסיטת ונדרבילט, והאפידמיולוג קארי צפון, דוקטורט, מאוניברסיטת צפון קרוליינה בצ'אפל היל.
החוקרים יחקרו האם וכיצד נגיפים שאינם פטוגניים ככל הנראה ממלאים תפקידים חשובים בבריאות האדם ובמחלות – בדומה לאופן בו המחקר של המיקרוביומה האנושית חשף תפקידים חשובים עבור חיידקים.
תחומי חקירה אחרים הם כיצד התמדה ויראלית ושילוב בגנום האנושי, אפילו ללא תסמינים, עשויים להשפיע באופן משמעותי על הפנוטיפים האנושיים ותוצאות הבריאות לאורך זמן, ואם ישנם הבדלים חשובים בתגובות המארחות לווירום הסביבה המניעים הבדלים בפנוטיפים אנושיים.
החוקרים אמרו כי הבנת הווירום האנושי הבריא עלולה להוביל לגילוי של סמנים ביולוגיים חדשים לבריאות ומחלות וגישות טיפוליות חדשות.
הנחת יסוד מרכזית בתוכנית הוויראום האנושי היא שהנגיף מקיים אינטראקציה משמעותית לא רק עם מערכת החיסון המארחת אלא גם עם המיקרוביומה האנושית. שיטות מחקר עיקריות המשמשות את מרכז אפיון הנגיף המתואם של ונדרבילט יכללו רצף מטגנומי שלם כדי ללכוד נגיפי DNA, רצף מטטרנסריפטומי שלם כדי להעריך נגיפי RNA, בידוד ויראלי ומחקרי טרופיזם (חושף העדפות רקמות של נגיפים), ושיטות שונות לאפיון תגובה מארח כמו ניתוח אינטגרציה גנומית מארחת, ניתוח של מצב דלקתי ומחקרי תגובה רירית.
המרכז החדש נתמך על ידי NIH Grant U54-AG089326.