מטה-אנליזה של מחקרים גנטיים המנתחים את המיקרוביוטה (חיידקים במעיים) של 1,275 תינוקות מעשר מדינות מוצאת כי לידה קיסרית ושימוש באנטיביוטיקה מניעים את העלייה בעומס הגנים העמידות לאנטיביוטיקה בקרב תינוקות, על פי מחקר חדש שהוצג השנה. ESCMID Global Congress (לשעבר ECCMID) בברצלונה, ספרד (27-30 באפריל).
המחקר, על ידי חוקרים מ- UiT The Artic University of Norway, מדגיש את הצורך הדחוף במחקר נוסף על התערבויות ממוקדות להפחתת עמידות לאנטיביוטיקה אצל תינוקות. הם משערים כי פרוביוטיקה, למשל, יכולה להפחית את שפע הגנים העמידות לאנטיביוטיקה ולזכות לחקירה נוספת.
עמידות מיקרוביאלית (AMR) היא מצב חירום בריאותי עולמי. זיהומים עמידים לתרופות הורגים יותר מ-1.27 מיליון אנשים בשנה ברחבי העולם. אם לא תינקט פעולה, עמידות לאנטי-מיקרוביאלית עלולה לעקוף את הסרטן כגורם המוות המוביל בעולם עד שנת 2050, והיא צפויה להרוג 10 מיליון אנשים ברחבי העולם.
תינוקות רגישים מאוד לזיהומים בשל מערכת החיסון הבלתי בשלה שלהם. יחד עם זאת, מיקרוביוטת המעיים שלהם מלאה בחיידקים מגוונים, שרבים מהם מכילים עמידות בפני מגוון רחב של אנטיביוטיקה, גם בהיעדר חשיפה לאנטיביוטיקה. התנגדות המעי – אוסף הגנים העמידים לאנטיביוטיקה (ARGs) המאוחסן בגנום של חיידקי מעי תינוקות – מתפתח כאשר חיידקים מציפים את המעי מיד לאחר הלידה, ומהווה חלק חשוב בפאזל AMR.
ה-Gut Mobileome- אוסף האלמנטים הגנטיים הניידים המגוונים (MGEs) בתוך המעי, ממלא תפקיד מפתח בהפצת ARGs. חיידקים מחליפים חומר גנטי, כמו ARGs, באמצעות העברת גנים אופקית. עם כל כך הרבה חיידקים בקרבת מקום, המעי מספק תנאים אידיאליים לחילופי ARGs זה.
בעוד שחיידקי מעיים רבים המכילים ARGs אינם מהווים איום בריאותי, חלק מה-ARGs נרכשים על ידי חיידקים בעלי פוטנציאל פתוגני. כאשר גנים אלו מועברים לפתוגן, יש לכך השלכות קשות הן על החולה הפרטי והן על החברה.
לכן, הבנת הגורמים המשפיעים על התפתחות התנגדות המעי והמובילום של התינוק היא חיונית לפיתוח אסטרטגיות להפחתת שכיחות AMR.
מספר מחקרים קליניים קודמים סיפקו תובנות חשובות אך מקוטעות לגבי התנגדות המעי, אך גדלי המדגם הקטנים וההטיות המובנות שלהם (למשל, הטיית בחירה ובלבול) מגבילים את יכולת ההכללה של הממצאים.
כדי להתגבר על מגבלות אלו, חוקרים ערכו מטה-אנליזה של קבוצות תינוקות המבוססת על נתוני מטאנומיה מ-14 מחקרים המשתרעים על פני 10 מדינות ושלוש יבשות.
הם חקרו את המידה שבה שימוש באנטיביוטיקה, מצב לידה, פגים, שיטות האכלה וגיאוגרפיה השפיעו על השפע והמגוון של ARGs ו-MGEs ב-3,981 דגימות צואה של מטאנום המעי מ-1,275 תינוקות. כדי לעקוב אחר המיקרוביום של התינוקות, צואה של תינוקות נדגמה לאורך עד גיל 14 חודשים.
חוקרים השתמשו במטאנומים של רובה ציד שפורסמו (רצף גנטי לא ממוקד של כל החיידקים החיים במעיים) כדי לבחון את הקשר בין המגוון והעומס של ARGs ו-MGEs ושימוש באנטיביוטיקה, מצב לידה, פגים, שיטות האכלה וגיאוגרפיה, כמו גם לזהות אילו מיני חיידקים הם מארחים עיקריים של ARGs בתוך המעיים של תינוקות.
בסך הכל, הניתוחים מצאו ששימוש באנטיביוטיקה, לידה קיסרית ופגות היו קשורים באופן מובהק למגוון מופחת של חיידקי המעיים בהשוואה לתינוקות שנולדו בטווח מלא, שנולדו בנרתיק, שלא נחשפו לאנטיביוטיקה.
מצד שני, לידה נרתיקית הייתה קשורה לשפע נמוך יותר אך ל-ARG מגוונים יותר בהשוואה ללידה בחתך קיסרי.
תינוקות שנולדו בנרתיק נחשפים ליותר חיידקי נרתיק ומעי בהשוואה לתינוקות שנולדו בחתך קיסרי, שנחשפים בעיקר לחיידקי עור. מאחר שחיידקים מתואמים עם אוסף הגנים העמידים לאנטיביוטיקה במעיים, צפוי מגוון גנים עמידים יותר לאנטיביוטיקה בתינוקות שנולדו בנרתיק. עם זאת, נוכחות של רמות גבוהות יותר של חיידקים קומנסאליים מסוימים – המספקים למארח שלהם חומרים מזינים חיוניים ומסייעים בהגנה על המארח מפני פתוגנים אופורטוניסטיים – בתינוקות שנולדו בנרתיק עלולה לדכא חיידקים פתוגניים (שסביר להניח שהם נושאים שפע גבוה יותר של אנטיביוטיקה- גנים עמידים), ובכך להפחית את השפע הכולל."
אחמד ברגוט, מחבר ראשי מ-UiT האוניברסיטה הארטית של נורווגיה
כצפוי, הניתוחים מצאו ששימוש באנטיביוטיקה היה קשור לשפע גבוה יותר של ARG ו-MGE. עם זאת, לשימוש באנטיביוטיקה לא הייתה השפעה משמעותית על המגוון של ה-ARGs.
באופן מפתיע, תינוקות יונקים באופן בלעדי לא הראו השפעות משמעותיות על המגוון או השפע של ARG.
חשוב לציין, החוקרים זיהו 199 ARGs רלוונטיים קלינית (המעניקים עמידות לאנטיביוטיקה רלוונטית קלינית), שהמגוון שלהם גדל עם הגיל במהלך השנתיים הראשונות לחייהם. "המגוון של ה-ARGs גדל עם הזמן, תוך שיקוף של מגוון החיידקים. עם זאת, שפע ה-ARGs ירד עם הזמן, אולי בגלל הפחתה בשפע החיידקים הפתוגניים כגון אי קולי", אומר ברגוט.
מעניין לציין ששתי קבוצות אפריקאיות (מזימבבואה ודרום אפריקה) היו בעלי שפע מובהק סטטיסטית וגבוהה יותר של ARG ו-MGE בהשוואה לקבוצות האירופיות. "ייתכן שזימבבואה ודרום אפריקה השתמשו יותר באנטיביוטיקה בקבוצת התינוקות שלהן מאשר האירופים", אומר ברגוט. "בזימבבווה, הרגולציה והבקרה של אנטיביוטיקה אינם קפדניים כמו באזורים מסוימים באירופה, מה שמוביל למצב שבו לעתים קרובות ניתן לרכוש אנטיביוטיקה ללא מרשם ללא מרשם, מה שעלול להחמיר עמידות לאנטי-מיקרוביאלית".
המחברים אישרו עוד אי – קולי כמארח העיקרי של ARGs במעיים של תינוקות, ובאופן מדאיג, כמעט מחצית מה-ARGs התמקמו יחד עם פלסמידים, מה שמאפשר העברה יעילה בין חיידקים. יתר על כן, אי – קולי נמצא כי מגוון הזנים מופחת במהלך ההנקה, אך גדל עם הגיל. מעניין שלשימוש באנטיביוטיקה לא הייתה השפעה משמעותית על אי – קולי זן גיוון.
"המטא-אנליזה שלנו של הראיות הזמינות מראה בבירור כי מתן חתך קיסרי, שימוש באנטיביוטיקה ופגים ממלאים תפקיד לא מוערך בעמידות לאנטיביוטיקה אצל תינוקות על ידי שינוי ההתנגדות והניוד לחיים המוקדמים, מה שמוביל לעלייה במעיים של גנים של עמידות לאנטיביוטיקה. אלמנטים גנטיים ניידים", אומר ברגוט.
"יש לכך השלכות חשובות על משבר העמידות לאנטיביוטיקה. על ידי השגת תובנה לגבי גורמים אלה, אנו שואפים לפתח התערבויות ממוקדות כמו פרוביוטיקה, שיכולות להפחית באופן משמעותי את מספר מקרי המוות הנגרמים עקב עמידות לאנטיביוטיקה. מחקר זה לא רק מתייחס לאתגר בריאותי עולמי דחוף אלא גם מכין את הבמה לפריצות דרך בטיפול רפואי ובקרת זיהומים ככל שאנו מתקדמים, ההתמקדות שלנו נשארת בהפיכת הממצאים הללו לאסטרטגיות מעשיות שיכולות להציל חיים ולבלום את התפשטות זיהומים עמידים.
למרות הממצאים החשובים, המחברים מציינים מספר מגבלות, לרבות שלא ניתן היה לבחון את השפעת האשפוז ומשתנים קליניים אחרים בניתוח זה עקב מחסור בנתונים.