מחקר: שכיחות מחלת Orthohantavirus אנושית והתפלגות גנוטיפ בארה"ב, 2008-2020: מחקר תצפית רטרוספקטיבי. קרדיט תמונה: CI Photos / Shutterstock
מדענים מהמרכזים האמריקאים לבקרת מחלות ומניעתן (CDC) ערכו מחקר כדי לקבוע את השכיחות והתפלגות הגנוטיפ של מחלת אורתוהנטווירוס אנושית בארצות הברית.
המחקר פורסם ב הבריאות האזורית לנצ'ט.
רֶקַע
Hantaviruses הם וירוסים מרובי-מקטעים בעלי חוש שלילי אשר בדרך כלל מדביקים מכרסמים. עם זאת, זיהום הנטאוויראלי שגולף יכול להתרחש בבני אדם בחשיפה להפרשות של מכרסם נגוע או עקב עקיצות מכרסמים. העברה מאדם לאדם תועדה רק עבור מין ויראלי בודד, כלומר, Orthohantavirus andesenseבדרום אמריקה.
נגיפי הנטה מהעולם הישן מסתובבים בעיקר באירופה ובאסיה ונמצאו כגורמים לקדחת דימומית של הנטאווירוס עם תסמונת כליות. מצד שני, נגיפי הנטאווירוס של העולם החדש מסתובבים בעיקר בצפון ודרום אמריקה ונמצאו כגורמים לתסמונת לב-ריאה של הנטאווירוס.
נכון לעכשיו, זיהום בנגיף האנטווירוס הוא מחלה בולטת לאומית בארצות הברית. מחלקות הבריאות מפינות שונות של המדינה מדווחות על מקרי נגיף הנטווירוס הנגועים בצורה חריפה למרשם המעקב הלאומי של ה-CDC. עם זאת, אתגר משמעותי שצוין במחקר הוא היעדר בדיקות סרולוגיות או PCR סטנדרטיות ברחבי ארה"ב, מה שהוביל לתוצאות סותרות בין מבחנים שפותחו על ידי CDC לבין בדיקות אבחון מסחריות.
קריטריונים לדיווח של מקרים חיוביים מבוססים על תסמינים קליניים ותוצאות אבחון מעבדתיות, כולל אימונוגלובולין M (IgM) חיובי, IgG חיובי עם טיטרים עולים, חיובי אימונוהיסטוכימיה או תגובת שרשרת פולימראז (PCR) חיובית.
בדיקת התייחסות CDC גילתה כי תוצאות חיוביות כוזבות של IgM נצפו מבחני אבחון מסחריים. זה מצביע על כך שכמה מקרים חריפים של הנטאווירוס עשויים להיות מוערכים יתר על המידה במדינות שאינן מאשרות תוצאות חיוביות עם בדיקות התייחסות.
במחקר תצפיתי זה, מדענים קבעו את השכיחות והתפלגות הגנוטיפ של מחלת הנטאווירוס האנושית בארצות הברית מ-2008 עד 2020.
עיצוב לימודים
המדענים ניתחו מערכי נתונים מרובים, כולל מקרים חריפים של הנטאווירוס שדווחו על ידי מחלקות הבריאות מ-1993 עד 2020 ומ-2008 עד 2020, כמו גם בדיקות אבחון חריפות והבראה של הנטאווירוס שבוצעו ב-CDC מ-2008 עד 2020.
דגימות חשודות ב-hantaviral שהוגשו ל-CDC נבדקו עבור העולם החדש Orthohantavirus- והעולם הישן (OW) אורתוהנטווירוסנוגדני IgM (דגימות חריפות) ו-IgG (דגימות הבראה) תגובתיות. היבט קריטי במחקר היה ריצוף של דגימות חיוביות ל-hantavirus כדי לזהות וריאנטים ויראליים ספציפיים והתפוצה הגיאוגרפית שלהם.
דגימות חיוביות ל-Hantavirus נותחו באמצעות רצף הדור הבא, וערכות נתונים אפידמיולוגיות וגנטיות זמינות נקשרו לביצוע מחקר אפידמיולוגי גנומי של מחלת ה-hantavirus בארצות הברית.
תצפיות חשובות
בין השנים 1993 ל-2020, אותרו 833 מקרים של נגיף האנטווירוס האנושי, ו-335 מקרים זוהו בין 2008 ל-2020 בארצות הברית. מתוכם, ה-CDC זיהה 115 דגימות חיוביות ל-hantavirus של העולם החדש, המהווים 29.2% מסך המקרים שזוהו.
מתוך מקרים אלה, 98 דווחו על ידי מחלקות הבריאות של המדינה, השבטים, המקומיים והטריטוריאליים. זה ייצג 29% מסך המקרים המאושרים החריפים שדווחו על ידי משרדי הבריאות.
מבין מקרי הנטאווירוס של העולם החדש שזוהו על ידי ה-CDC, כ-85% זוהו במהלך מחלה חריפה. עם זאת, כמה מקרי הבראה זוהו בקונטיקט, מיזורי, ניו ג'רזי, פנסילבניה, טנסי וורמונט. אזורים אלה לא היו קשורים בדרך כלל לזיהומים ב-hantavirus.
מבין מקרי הנטאווירוס שהתגלו בארצות הברית בין השנים 1993 ל-2020, זוהו כ-95% במערב המיסיסיפי, ו-45% זוהו באזור ארבע הפינות. כמה מקרים זוהו גם באזורי המערב התיכון העליון, אמצע האוקיינוס האטלנטי וצפון מזרח. לעומת זאת, רק מקרים בודדים זוהו באזורי דרום מזרח.
מבין מקרי הנטאווירוס של העולם החדש שזוהו בין 2008 ל-2020, כ-68% התרחשו בין מרץ לאוגוסט.
המחקר זיהה גם וריאנטים ויראליים ספציפיים הקשורים לאזורים גיאוגרפיים שונים. ההתפלגות הגיאוגרפית של Orthohantavirus sinnombreense המינים נקבעו על ידי רצף מקרים חיוביים ל-PCR. זה הוביל לגילוי נגיף ה-Sin Nombre בעיקר במערב נהרות המיסיסיפי ואוהיו, נגיף ה-Monongahela באזורים הצפון-מזרחיים והאמצע-אטלנטיים והנגיף של ניו יורק בלונג איילנד. עם זאת, היה פער משמעותי בנתוני הרצף הנגיפי מצפון-מערב ומרכז ארה"ב. רק מקרה אחד של זיהום בנגיף Sin Nombre זוהה באינדיאנה.
משמעות המחקר
המחקר מספק תצוגה מעודכנת של התפוצה המרחבית והזמנית של מקרי הנטוויראל אנושיים בארצות הברית.
כמעט 95% מהמקרים זוהו ממערב למיסיסיפי בין מרץ לאוגוסט. לעומת זאת, רק 45% זוהו באזור ארבע הפינות הדרום מערביות, הקשורים באופן מסורתי לזיהומים הנטאוויראליים.
המחקר מדגיש את הצורך באלגוריתמים סטנדרטיים יותר של בדיקות אבחון ברחבי ארה"ב כדי לצמצם אי-קורונריות בין שיטות בדיקה שונות. שכיחות נמוכה של מחלה הנטוויראלית נצפתה בדרום-מזרח ובאמצע אמצע האוקיינוס האטלנטי ארה"ב. הדבר עשוי לנבוע מהיעדר מקרים אנושיים או מדיווח נמוך או בדיקה של מקרים אנושיים בגלל זיהומים קלים או אסימפטומטיים.
מכיוון שהאזורים הללו נמצאים בטווח הביתי של וקטורי מכרסמים ידועים של Hantavirus, יש צורך בניטור קפדני של מקרים אנושיים זליגים כדי למנוע איומים פוטנציאליים על בריאות הציבור. המחקר מדגיש את הצורך באלגוריתמים סטנדרטיים יותר של בדיקות אבחון ברחבי ארה"ב כדי לצמצם אי-קורונריות בין שיטות בדיקה שונות.
