קונסורציום מחקר בינלאומי בראשות מדענים מהמרכז הרפואי של אוניברסיטת ונדרבילט, אוניברסיטת טורונטו ואוניברסיטת פיטסבורג מיפה את ההשפעה התפקודית של יותר מ-17,000 וריאנטים בגן עיקרי הקשור להתפתחות מחלת לב טרשתית מוקדמת.
המחקר, דווח ב-30 באוקטובר בכתב העת מַדָעיובילו דרך ארוכה לשיפור האבחון והטיפול המוקדם של היפרכולסטרולמיה משפחתית (FH), גורם גנטי שכיח למחלות לב וכלי דם המופיע בכ-1 מכל 250 אנשים, ציינו החוקרים.
FH אינו מאובחן ולא מטופל, בין השאר בגלל היעדר הסיווג, או קביעת הפתוגניות (היכולת לגרום למחלה), עבור רוב הווריאציות החדשות שהתגלו במהלך בדיקות גנטיות במרפאה.
לציוני ההשפעה החדשים של הווריאציות "יש פוטנציאל להגדיל את מספר האבחנות (FH) עבור אלו עם וריאנטים לא מסווגים בפקטור של 10", חזה דן רודן, MD, מחבר שותף של הדו"ח וסגן נשיא בכיר לרפואה מותאמת אישית ב-VUMC.
רודן, סם ל. קלארק, ד"ר, פרופסור דוקטור לרפואה, פרמקולוגיה ואינפורמטיקה ביו-רפואית, הוא חוקר ראשי במענק בן ארבע שנים של 8.2 מיליון דולר שהוענקו בשנת 2022 על ידי המכון הלאומי ללב, ריאות ודם של המכון הלאומי לבריאות (NIH) למיפוי וריאציות גנטיות המשפיעות לרעה על תפקוד הלב.
חוקרים משותפים (ומחברים משותפים של ה מַדָע נייר) הם פרדריק רוט, דוקטורט, בית הספר לרפואה של אוניברסיטת פיטסבורג; Euan Ashley, MBChB, DPhil, וויקטוריה פאריך, MD, בית הספר לרפואה של אוניברסיטת סטנפורד; Calum MacRae, MD, PhD, בית הספר לרפואה של הרווארד; ואנדרו גלזר, PhD, וברט Kroncke, PhD, עוזרי פרופסורים לרפואה ב-VUMC.
רוט, שידוע בינלאומי בעבודתו בביולוגיה חישובית ובגנומיקה, הוביל את המחקר, שנערך בעיקר באוניברסיטת טורונטו ובסיני בריאות בטורונטו. כיום הוא יושב ראש המחלקה לביולוגיה חישובית ומערכות בפיט.
המחקר התמקד בווריאציות בגן לקולטן ליפופרוטאינים בצפיפות נמוכה (LDLR), שבדרך כלל מנקה את הדם מכולסטרול LDL, גורם עיקרי בהצטברות רובד טרשתי על דפנות כלי הדם.
החוקרים פיתחו, מיטבו ואימתו מגוון של מבחני תאים בעלי תפוקה גבוהה למדידת תפקוד וריאנטים ולהבחין בין וריאנטים פתוגניים לשפירים. הם השתמשו בטכניקות חדשניות כדי לקבוע את ההשפעה התפקודית של אלפי וריאנטים של גנים LDLR על פינוי LDL ועל שפע קולטני LDL על פני התא.
המטרה היא לפתח מערכת תומכת החלטות ממוקדת וריאנטים שתשותף באופן נרחב כדי לסייע לרופאים להעריך עדויות תפקודיות למחלות לב בחולים העוברים בדיקות גנטיות, ובכך להקל על טיפול מותאם אישית.
"על ידי זיהוי גרסאות מזיקות של קולטני LDL, רופאים יכולים להתחיל טיפול מונע בשלב מוקדם ולהפחית סיכונים", אמר רוט בהודעה לעיתונות.
עמית פוסט-דוקטורט דניאל טאבט, דוקטור, ועמיתת מחקר בכירה Atina Coté, PhD, באוניברסיטת טורונטו, הובילו את עבודת הניסוי המרכזית במחקר והם המחברים הראשונים של המאמר. עמיתת קלינית VUMC לשעבר מייגן לנקסטר, MD, PhD, כעת באוניברסיטת אוהיו סטייט, עזרה להעריך את הנתונים.
מחברים שותפים אחרים הם מאוניברסיטת ווסטרן של לונדון, אונטריו, אוניברסיטת הלסינקי, אוניברסיטת קייס ווסטרן רזרב, אוניברסיטת וושינגטון, אוניברסיטת ליסבון, והמכון ברוד של MIT והרווארד.
המחקר נתמך על ידי מענקי NIH R01HL164675 ו-RM1HG010461; יוזמת One Brave Idea Initiative, במימון משותף על ידי איגוד הלב האמריקאי, Verily Life Sciences LLC ו-Astra-Zeneca Inc.; קרן קנדה לחדשנות; המכון הקנדי לחקר הבריאות; תוכנית כיסאות מחקר מצוינות בקנדה; אופק האיחוד האירופי וקרן לה קייסה.
