תסמונת האנדותל (ICE) IRIDOCORNEAL (ICE) היא הפרעה נדירה, מסנוורת באופן בלתי הפיך, עם אטיולוגיה לא ידועה. היעדר תרופות יעילות ממוקדות, פרוגנוזה לא מספקת של מחלות ושיעורי הישנות גבוהים לאחר הניתוח הם האתגרים הנוכחיים של הקרח. לפיכך, הבנת הנוף הגנומי והאפיגנומי שלה יכולה לסייע בפיתוח טיפולים מבוססי אטיולוגיה.
מחקר זה, שפורסם ב גנים ומחלות כתב העת על ידי צוות מאוניברסיטת סאן ית-סן, האוניברסיטה הרפואית בגואנגג'ואו, האוניברסיטה הרפואית של פוג'יאן, האוניברסיטה הרפואית הראשונה של שאנדונג, אוניברסיטת חואזונג למדע וטכנולוגיה, אוניברסיטת נאנצ'אנג, האוניברסיטה הרפואית נאנג'ינג, סין שלוש גורס, אוניברסיטת הרפואה, באוניברסיטת גנומיה, באוניברסיטת גנומיה, מספקת גנומיה, אוניברסיטת אפיגנה, באוניברסיטת מקאאו, באוניברסיטת מקאאו, ואוניברסיטת מקאו, ואוניברסיטת מקאו, תסמונת, עם פוטנציאל ליידע את התפתחותם של טיפולים מבוססי אטיולוגיה.
החוקרים גייסו 99 חולי ICE וביצעו רצף גנום שלם (WGS) על 51 ובמילוי מתילציה של DNA רחב גנום על 48. בדיקת נטל מוטציה נערכה כדי להשוות את קבוצת הקרח עם קבוצות ביקורת, וחשפה קשר משמעותי בין RP1L1 (רטיניטיס דלקת 1 כמו דמויי 1) לגן ותסריט קרח.
לאחר מכן חקרו החוקרים וריאציה של מספר העותקים (CNV) בתסמונת הקרח וזיהו 41 אזורים עם CNVs משמעותיים, כולל שלושה אזורים ב- Chr19: 15783859-15791329 (HG19), Chr3: 75786061-7579087 (HG19) ו- Chr3: 5527666856856856856856856856667 (552720, 552720 אז) (HG19), המציג אובדן מספר העתקה בקרב 39, 19 ו -5 חולים, בהתאמה. בנוסף, מחקר זה הצביע על כך שאובדן מספר העתקה של גנים CYP4F12, ZNF717 ו- KIR2DL1 עשויים לגרום לתפקוד לקוי של תאי אנדותל קרנית והמרה פתולוגית הנגרמת על ידי זיהום נגיפי של תאי אנדותל קרנית בתסמונת הקרח.
מחקר זה זיהה גם 2,717 אזורים מתיליים דיפרנציאלים (DMRs), כאשר היפומטילציה נפוצה בתסמונת הקרח (91.9% מ- DMRs). מבין אלה, 45 אזורים היפומטילטיים חוזרים ונשנים (HMRs) בקרב יותר מ- 10% מחולי ICE הראו מתילציה דיפרנציאלית בהשוואה לביקורת תקינה. מעניין לציין כי החוקרים מצאו כי Chr2_95692705_95692728 (HG19), ה- HMR המזוהה בתדירות הגבוהה ביותר בקרב חולי ICE, טמון על המקדם של הגן MAL. זה מצביע על כך שההיפומטילציה של מקדם וביטוי מוגבר של MAL עשויים לתרום להיפרפלזיה של אפיתליואיד של תאי אנדותל קרנית בתסמונת הקרח.
ממצאי המפתח של מחקר זה כוללים זיהוי של גנים פתוגניים בחולים עם תסמונת ICE הקשורים למחלות עיניים, חסינות נגיפית והיפרפלזיה אפיתליואיד. ממצאים אלה מראים כי זיהומים נגיפיים עלולים לעורר את הטרנספורמציה הפתולוגית של תאי אנדותל קרנית על סמך רגישות גנטית ואפיגנטית אלה, מה שמוביל להתפתחות תסמונת הקרח. לסיכום, מחקר זה מייצג את הניתוח הגנומי והאפיגנומי המקיף הראשון של תסמונת הקרח באמצעות רצף הדור הבא ללא משוא פנים.
