שיתוף פעולה רב-מרכזי בראשות חוקרים ממרכז הסרטן המקיף של סילבסטר בבית הספר לרפואה של אוניברסיטת מיאמי מילר, יצר את המודל החישובי הראשון למיאלומה נפוצה שאובחנה לאחרונה, המנבא את הפרוגנוזה המותאמת אישית של הפרט על סמך הגנומיה והטיפולים של הגידול.
מודל החיזוי לסיכון אינדיבידואלי במיאלומה נפוצה שאובחנה לאחרונה, או IRMa, משתפר בכלים פרוגנוסטיים קודמים מכיוון שהוא לוקח בחשבון את הביולוגיה של הגידולים של חולים, אמרה ד"ר סי אולה לנדגרן, ראש חטיבת מיאלומה ומנהלת מכון סילבסטר מיאלומה, מחבר בכיר של מאמר שחשף את הכלי החדש ב- כתב עת לאונקולוגיה קלינית. זה חשוב בסוגי סרטן רבים, אבל במיוחד במיאלומה נפוצה, שהיא מאוד משתנה. למעשה, החוקרים זיהו 12 תת-סוגים נפרדים של המחלה, סיווג שלא נעשה קודם לכן.
עתיד התחום יצטרך להיות ממוקד ברפואה מדויקת. אין דרך אחרת קדימה".
ד"ר סי אולה לנדגרן, ראש אגף מיאלומה ומנהלת מכון סילבסטר מיאלומה
השיטה המקורית לסיווג מיאלומה נפוצה, שפותחה בשנות ה-70, התבססה על סיווג גידולים מוצקים. זה הסתמך על כמות הסרטן שקיים, ועם הטיפולים הזמינים באותה תקופה, זה היה די מדויק, אמר לנדגרן. אבל עם טיפולים חדשים שפותחו, במיוחד אימונותרפיות, כמות הסרטן היא לרוב פחות חשובה מאופי התאים הסרטניים. סוגים שונים של מוטציות מובילות בגנום הגידול משפיעות על צמיחת הסרטן, כך שלתת-סוגים מסוימים של מיאלומה יכולים להיות תוצאה טובה מאוד גם אם הם מאובחנים כשהסרטן נפוץ, בהנחה שהטיפול הנכון מותאם למטופל.
מספר אפשרויות הטיפול במחלה גדל באופן דרמטי בשני העשורים האחרונים, והחולים חיים יותר עם המחלה. אבל עם כל כך הרבה אפשרויות טיפוליות, רופאים צריכים דרך לחזות איזה טיפול יעבוד הכי טוב עבור כל מטופל.
ד"ר פרנצ'סקו מאורה, עוזר פרופסור בסילבסטר והמחבר הראשון של המחקר, אמר שלמרות שהכלים הפרוגנוסטיים עודכנו במהלך השנים, התחום עדיין חסר חיזוי מדויק. חלק מהכלים כללו תכונות גנומיות של הגידול, אך לאחרונה היו ממצאים חדשים לגבי גורמי סיכון גנומיים שעדיין לא נכללו במודל חיזוי. וכל הכלים עד כה הסתמכו על ממוצעים של אוכלוסייה, חיברו את המטופלים לקבוצות כמו "סיכון סטנדרטי" ו"סיכון גבוה" ונתנו פרוגרסאות עבור אותן קבוצות בסך הכל שלא לקחו בחשבון סיכון אינדיבידואלי וכיצד ניתן לשנות זאת על ידי טיפולים שונים.
"המודל שלנו מבוסס על הרעיון של ניבוי הסיכון של המטופל הבודד ולא של הקבוצה", אמרה מאורה.
מכיוון שהוא נבנה באמצעות למידה עמוקה, IRmma יכול ללמוד ולהשתפר ככל שהוא מקבל יותר נתונים. המודל בנוי באופן המאפשר להוסיף מערכי נתונים מתעוררים עם אסטרטגיות טיפול עתידיות. צוות המחקר עובד כעת על הכללת מערכי נתונים נוספים מחולים שטופלו בטיפולים חדשים יותר מבוססי נוגדנים במיאלומה נפוצה.
כדי לבנות את המודל, החוקרים של סילבסטר ומשתפי הפעולה שלהם השתמשו בנתונים גנטיים, טיפוליים וקליניים של כמעט 2,000 חולים שאובחנו לאחרונה עם מיאלומה נפוצה. מרצפים של ה-DNA של החולים, המדענים זיהו לראשונה 90 "גנים מובילים" -; גנים הנושאים מוטציות בתאי הסרטן שנראים כממריצים את צמיחת הגידול. לאחר מכן הם בדקו את הטיפולים שקיבל כל מטופל במערך הנתונים שלו וכיצד התמודדו המטופלים בטיפולים אלה, תוך התאמת תוצאת הטיפול לרצפים הגנטיים של הגידול של הפרט.
צוות סילבסטר עבד עם מדענים במרכז הסרטן Memorial Sloan Kettering, NYU Langone Health, Moffitt Cancer Center ובית החולים האוניברסיטאי היידלברג כדי לצבור את נתוני המטופלים. המודל זמין באינטרנט לשימוש כל אחד, למרות שהאיטרציה הנוכחית שלו מכוונת לחוקרים ולא לרופאים, אמרה מאורה. זה יכול להיות שימושי עבור חוקרים המפרשים או מעצבים ניסויים קליניים חדשים, למשל, כדי לספק קבוצה גדולה של השוואות לטיפול הניסיוני.
מאורה ועמיתיו שואפים גם לשפר את המודל על ידי שילוב נתונים נוספים על המטופלים.
"המודל הזה יכול לצמוח רק בעזרת קהילת המחקר", אמרה מאורה. "האתגר הבא הוא להמשיך להאכיל אותו עם מערכי הנתונים הנכונים כך שבשלב מסוים הוא יהיה שמיש למטרות קליניות."
IRMa גם גמיש. ניתן לשנות את הפרוגנוזה של מטופל מהמודל אם, למשל, הוא מקבל השתלה לאחר טיפול נתון. כאשר טיפולים חדשים יהיו זמינים, כל עוד יש נתונים של לפחות כמה מאות מטופלים, ניתן לעדכן את המודל כך שישלב את הטיפולים הללו.
בעוד שהתחום לא ממש בנקודה של רצף גנום גידול שלם עבור כל חולה שאובחן לאחרונה, זה עשוי להגיע בעתיד הקרוב ככל שרצף הגנום השלם הופך לחסכוני יותר, אמר לנדגרן.
"יותר ויותר מידע יהפוך לזמין, וכלים כמו המודל הזה הם העתיד לטיפול וניהול אופטימליים", אמר.
