Search
פלטפורמת אבחון שתן ניתנת לשאיפה לזיהוי מוקדם של סרטן ריאות

מדענים ממפים את כל התוצאות האפשריות של שינויים בגן מפתח מדכא גידולים

חוקרים ממכון פרנסיס קריק מיפו את כל התוצאות האפשריות של שינויים בגן מדכא גידולים הנקרא VHLהצעד הראשון במאמץ מחקר ענק לבטל את בחירת התוצאות של עשרות אלפי וריאציות גנטיות בגנים הקשורים לסרטן.

מפת VHL זו יכולה לעזור לרופאים להבין אילו מטופלים נמצאים בסיכון לפתח סרטן כליות או עשויים להגיב לתרופות מסוימות.

שינויים גנטיים או וריאנטים מתרחשים כאשר אבני בניין אחד או יותר ב-DNA משתנים. גם גרסאות נרכשות וגם בירושה ב- VHL הגן יכול להגביר את הסיכון לסרטן הכליות. אבל אנשים רבים מאובחנים עם 'וריאנטים בעלות משמעות לא ידועה' ב VHL ואינם יודעים מה זה אומר על הסיכון שלהם לסרטן.

במחקר שפורסם היום ב גנטיקה של הטבעחוקרים בקריק השתמשו בשיטה חדשה בשם עריכת גנום רוויה1 כדי לעקוב אחר הפונקציה של למעלה מ-2,000 שונים VHL וריאנטים בתאים אנושיים לאורך זמן.

הם מדדו כמה תאים שרדו עם כל אחד VHL וריאנט, שקיבל אז 'ציון פונקציה': ככל שהניקוד נמוך יותר, הווריאציה מזיקה יותר.

רוב ה VHL גרסאות שנותחו לא השפיעו על הישרדות התאים, מה שמצביע על כך שלאנשים עם גרסאות אלו אין סיכון גבוה יותר באופן משמעותי. עם זאת, וריאנטים אחרים הוכחו כפגומים בפעם הראשונה, כלומר חולים עם וריאנטים אלה עשויים להיות מוצעים כעת בדיקה קבועה כדי להפחית את הסיכון שלהם לסרטן.

הגרסאות המזיקות ביותר גרמו למות התאים. הצוות מצא שהפגום VHL גן הגביר את הפעילות של גן אחר שנקרא ח אם. הגן הזה נחוץ כדי לעזור לתאים לשרוד בחמצן נמוך, אבל יותר מדי חלבון HIF יכול לגרום לגידולים.

מסיר ח אם מתאים עם אלה VHL מוטציות שמרו על התאים בחיים, והראו שההשפעות השליליות של VHL תלויות ב ח אם.

בלזוטיפן, תרופה המעכבת את חלבון HIF, פועלת רק עבור אנשים עם מוטציות המשפיעות על כמות ה-HIF הקיימת בתאים. מערכת הניקוד שפותחה על ידי צוות קריק יכולה לזהות אנשים VHL מוטציות שירוויחו מטיפול בלזוטיפן.

לבסוף, החוקרים השוו את מערכת הניקוד שלהם עם מאגרי מידע זמינים לציבור על סרטן הכליות, ומצאו שהשיטה שלהם יכולה לחזות גרסאות גורמות סרטן שזוהו בעבר במרפאה בדיוק של 100%.

להרבה אנשים אומרים שיש להם 'וריאנט בעל משמעות לא ידועה' ב VHL גן והם בחושך לגבי מה זה אומר על הסיכון שלהם לסרטן. ציון תפקוד הווריאציה שלנו יכול להיות מבחן שימושי קלינית לקטגוריית חולים. למעשה, אנו מראים שחולים עם הציון הנמוך ביותר VHL גרסאות נוטות לחלות בסרטן הכליות בשיעור הגבוה ביותר. כעת אנו פועלים ליישם שיטה זו ליותר גנים כדי להביא לרמה זו של דיוק אבחון ליותר אנשים".

גרג פינדליי, ראש קבוצה של מעבדת תפקוד הגנום, מכון פרנסיס קריק

מייגן באקלי, סופרת ראשונה ודוקטורנטית נוכחית באוניברסיטת קיימברידג', אמרה: "על ידי כוונון עדין של שיטת עריכת הגנום הרוויה, הראינו שבדיקה פשוטה יחסית יכולה לזהות מה שונה VHL מוטציות עושות בתאים אנושיים. למרבה ההפתעה, להרבה וריאנטים הקשורים פוטנציאליים לסרטן היו ציונים ניטרליים בבדיקה זו, מה שמרמז שמערכת הניקוד יכולה להביא בהירות לחולים בלימבו לגבי מה שלהם VHL אבחון פירושו."

המעבדה עובדת כעת עם המעבדה לדינמיקה של סרטן בקריק כדי לעקוב עד כמה ציון התפקוד יכול לחזות את צמיחת הגידול והתגובה לטיפול בחולים עם VHL מוטציות. הם גם עובדים עם Wellcome Sanger Institute ו-The Institute of Cancer Research, London כדי למפות את כל ההשפעות השונות על פני 15 גנים אחרים בסיכון לסרטן.

מחקר זה בוצע בשיתוף פעולה עם המעבדה של ז'ניה איוואקין בבית החולים לילדים חולים בטורונטו, קנדה, המעבדה לדינמיקת הסרטן של קריק בראשות סמרה טוראג'ליק, ואתינה גאנר ועמיתיה באוניברסיטת פרייבורג בגרמניה. המימון ניתן על ידי מכון פרנסיס קריק, מחקר הסרטן בבריטניה, VHL בריטניה/אירלנד וקרן המחקר הגרמנית.

דילוג לתוכן