חוקרים ממעבדת ג'אנג ליי פיתחו כלי פורץ דרך המהפך את האופן בו החוקרים מעצבים פריימרים לגילוי פתוגנים. צינור חדש זה, הסורק גנומים שלמים כדי לזהות את מערכות הפריימר היעילות ביותר, עשוי לשפר משמעותית את המהירות והדיוק של אבחון מחלות זיהומיות. הממצאים, שפורסמו ב- 15 בפברואר 2025 ב גבולות מדעי המחשבהתייחס לאתגר קריטי בעיצוב פריימר PCR (QPCR) כמותי.
בניגוד לתוכנות קיימות הדורשות בחירה ידנית של גנים או אזורים ספציפיים, כלי חדש זה מחפש אוטומטית על פני הגנום כולו, מה שמקל על החוקרים לפתח בדיקות ספציפיות ורגישות מאוד לפתוגנים. על ידי אוטומציה של תהליך תכנון פריימר על פני גנומים שלמים, הצינור המאפשר זיהוי מהיר יותר ומדויק יותר של מיקרואורגניזמים הגורמים למחלות, שעלולים להיות בעלי השלכות מרחיקות לכת על בריאות הציבור. הצוות הדגים את יעילותו של הכלי על ידי תכנון פריימרים כדי להבחין בין שני פתוגנים פטרייתיים הקשורים זה לזה, Cryptococcus gattii ו- Cryptococcus neoformans. בבדיקות מעבדה, הפריימרים הראו ספציפיות מדהימה, והגבירו רק את פתוגני היעד תוך הימנעות מחיובי שווא מתשעה מיני בקרה אחרים.
חידוש זה מגיע בזמן מכריע, שכן הקהילה העולמית ממשיכה להתמודד עם האתגרים של פתוגנים המתפתחים במהירות. החוקרים מאמינים כי הכלי שלהם יכול להיות בעל ערך במיוחד לתכנון פריימרים לוירוסים ופטריות, מה שעלול להאיץ את התגובה למחלות זיהומיות מתעוררות. הצינור זמין בחופשיות כחבילת פיתון, ומאפשר לחוקרים ברחבי העולם לגשת ולנצל משאב חדש חזק זה. כאשר הקהילה המדעית חובקת כלי זה, היא עלולה להוביל לבדיקות אבחון מהירות ומדויקות יותר, ובסופו של דבר לשפר את הטיפול בחולים ותוצאות בריאות הציבור.
