מכריזה על פרסום חדש עבור אקטה מטריה מדיקה כְּתַב הָעֵת. חלבונים הם מקרומולקולות חיוניות המבצעות פונקציות בהתאם לדינמיקה הקונפורמטיבית שלהן. חקר השינויים הקונפורמטיביים הנגרמים על ידי מוטציות חלבון היא הגישה הסטנדרטית המשמשת להבנת המנגנונים העומדים בבסיס תהליכים פיזיולוגיים ופתולוגיים הקשורים למוטציה.
כדי לשפר את היעילות ולהקטין את ההוצאות של ניסויים ביולוגיים, מאמר זה מציג שיטה ליצירת חלבונים שעברו מוטציה באמצעות התקפות יריבות על מודל AlphaFold2 (AF2). השינוי במבנה של רצפי חלבון נגדיים שנחזה על ידי AF2 נחקר בהשוואה למבנה של חלבון מסוג הבר. ניסויי CASP14 הצביעו על כך ששינוי של שלושה שיירים בלבד באמצעות החלפה, מחיקה או החדרה הוביל להפרש של 46.61 נקודות בתחזיות של AF2, על פי מבחן המרחק המקומי (lDDT).
השיטה יושמה על טרנספורטר השומנים הטרנסממברני SPNS2 כדי לזהות שאריות חיוניות ולהציע קונפורמציות חלופות פוטנציאליות, ובכך לייעל את שלב הניסוי בקביעת מבנה ומחקרים מכניסטיים.
