טכנולוגיית גנוטייפ מזהה גרסאות של קוביד במהירות ובזול יותר מאי פעם – על פי מחקר מאוניברסיטת מזרח אנגליה וסוכנות הבריאות הבריטית.
מחקר חדש שפורסם היום מגלה שהטכניקה מזהה גרסאות חדשות כמעט שבוע מהר יותר משיטות רצף גנום שלם מסורתיות.
צוות המחקר אומר שהגנוטיפ אפשר לזהות מידע על וריאנטים של קוביד במהירות רבה יותר ולהעביר אותו לאנשי מקצוע בתחום ההגנה על הבריאות בשיאה של המגיפה.
חשוב לציין, זה עזר ליישם אמצעי בקרה מקומיים כמו איתור מגע מהר יותר.
החוקר הראשי פרופ' איאן לייק, מבית הספר למדעי הסביבה של UEA, אמר: "כאשר החלה מגיפת קוביד, הגרסה שבה אנשים נדבקו נקבעה בתחילה באמצעות טכניקה מדויקת ביותר המכונה רצף גנום שלם.
"זהו כלי האבחון של תקן הזהב לזיהוי ואפיון גנטי של וריאנטים. אבל היכן שצריך להעריך במהירות אוכלוסיות גדולות – אז העלות, הקיבולת והזמן מגבילים את התועלת שלו.
"עד תחילת 2021, טכנולוגיה חדשה לזיהוי מהיר של גרסאות חדשות נבדקה על ידי הממשלה במעבדות הבדיקה והמעקב של NHS.
"הטכנולוגיה – המכונה 'בדיקת בדיקת גנוטיפ' או גנוטיפ – מאפשרת למדענים לחקור גרסאות גנטיות".
רצינו לגלות איך הטכנולוגיה הזו משתווה לרצף גנום שלם מסורתי".
ניל בריי, מסוכנות הבריאות הבריטית (UKHSA)
צוות המחקר חקר נתונים עבור יותר מ-115,000 מקרים שבהם מידע על וריאנטים של קוביד היה זמין הן מגנוטיפים והן מרצף גנום שלם.
על ידי השוואה בין תוצאת הווריאציה מגנוטייפ לתוצאה של ריצוף הגנום השלם, הם הוכיחו שתוצאות הגנוטיפים היו מדויקות מאוד.
פרופ' לייק אמר: "מצאנו שהגנוטיפ היה מסוגל לזהות גרסאות ידועות של קוביד מהר יותר ובזול יותר מאותו רצף הגנום כולו.
"הם הפיקו תוצאות שונות שישה ימים מהר יותר מאשר רצף גנום שלם – עם תוצאות חזרה תוך שלושה ימים בלבד, בהשוואה לתשעה ימים עבור רצף גנום שלם.
"הגנוטיפ אפשרה עלייה של פי תשעה בכמות הדגימות שנבדקו עבור גרסאות. המשמעות היא שזוהו גרסאות בקרב אנשים רבים יותר.
"אמצעי בקרה מקומיים כגון איתור מגע עשויים להתרחש מהר יותר.
"ניתן ליישם גנוטייפ למציאת וריאנטים במגוון רחב של אורגניזמים בבני אדם ובבעלי חיים – כך שיש לו פוטנציאל עצום להנחות קבלת החלטות בריאות הציבור ובקרת מחלות בעולם בעתיד."
פרופסור סוזן הופקינס, היועצת הרפואית הראשית של UKHSA, אמרה: "מומחיות הגנומיקה המובילה בעולם ש-UKHSA ומוסדות אחרים ברחבי בריטניה הצליחו להסתמך עליה במהלך המגיפה הייתה קריטית לתגובה של בריטניה ל-COVID-19.
"מחקר כזה יעזור לנו להמשיך ולהתבסס על היכולת שלנו בתחום זה ולהבטיח שבריטניה תהיה מוכנה ככל האפשר להגיב במהירות לאיומים המתעוררים על בריאות הציבור בעתיד".
פרופסור דאם אנה דומיניצ'ק, המדענית הראשית לבריאות בסקוטלנד, שהובילה בעבר את פעולת ממשלת בריטניה להרחבת והפעלת מעבדות המגדלור של קוביד, אמרה: "מחקר כמו זה חשוב באמת כדי להבטיח שאנחנו מתבססים על ההתקדמות העצומה בבדיקות שהתרחשו. במהלך קוביד כדי לחזק את ההגנות שלנו מפני איומי מגיפה עתידיים."
העבודה מומנה על ידי UKHSA והמכון הלאומי לחקר בריאות וטיפול (NIHR) יחידת המחקר להגנת הבריאות במוכנות ותגובה לשעת חירום.
מחקר זה הובל על ידי UEA בשיתוף סוכנות הבריאות הבריטית (UKHSA), BioClavis Ltd, Thermo Fisher Scientific (ארה"ב), NHS Test and Trace, המחלקה לבריאות ושירותים חברתיים, המכון הלאומי לחקר בריאות וטיפול ( NIHR), Alderley Lighthouse Labs Ltd, ואוניברסיטת גלזגו.
"מבחני גנוטיפ RT-PCR לזיהוי גרסאות SARS-CoV-2 באנגליה בשנת 2021: מחקר עיצוב והערכה רטרוספקטיבית" מתפרסם ב- המיקרוב Lancet.
