לאחרונה Lancet Microbe המחקר בוחן את האבולוציה התוך-מארח ואת גורמי הסיכון הקשורים לזיהום מתמשך בתסמונת נשימה חריפה חריפה בנגיף קורונה 2 (SARS-CoV-2) בחולים עם דכאות חיסונית.
לימוד: נשירה ואבולוציה של SARS-CoV-2 בחולים מדוכאי חיסון במהלך תקופת האומיקרון: ניתוח פרוספקטיבי רב-מרכזי. קרדיט תמונה: Sabrewolf / Shutterstock.com
רקע כללי
חולים מדוכאי חיסון הם הפגיעים ביותר לזיהום SARS-CoV-2, מכיוון שהם עשויים שלא לפתח חסינות מספקת והם מוגנים פחות על ידי חיסונים. מחקרים קודמים הראו שחולים מדוכאי חיסון, במיוחד אלו שאובחנו עם תסמונת חוסר אוטואימוני (איידס), נמצאים בסיכון גבוה יותר לזיהום ממושך; עם זאת, רוב המחקרים הללו הם רטרוספקטיביים ונתונים במידה מסוימת של הטיה.
ההפצה של גרסאות SARS-CoV-2 החדשות מוגבלת בעיקר על ידי הדינמיקה הסטוכסטית של שידור וסילוק המארח. עם זאת, שכפול בתוך המארח בחולים מדוכאי חיסון יכול להציע מספיק זמן לנגיף לרכוש מוטציות.
מדענים שיערו כי גרסאות SARS-CoV-2 של דאגה (VOCs), כגון גרסאות אלפא (B.1.1.7) ו-Omicron (BA.1), מקורן במהלך זיהומים ממושכים אצל אנשים עם דכאות חיסונית. עדיין לא ברור אם התערבויות קיימות יפחיתו או יקלו על התפתחותם של וריאנטים בעלי מוטציה גבוהה בחולים עם דחיקה חיסונית.
לגבי המחקר
כדי לתת מענה לשאלות דחופות על זיהום ב-SARS-CoV-2 אצל אנשים עם דחיקה חיסונית, החוקרים ערכו מעקב פרוספקטיבי בחולי חוץ ובאשפוזים שאובחנו עם זיהום SARS-CoV-2 Omicron. מחקר פרוספקטיבי ורב-מרכזי זה כלל מטופלים בוגרים מחמישה מרכזים רפואיים בארצות הברית, שכולם היו מדוכאי חיסון ונבדקו חיוביים ל-COVID- ב-14 הימים שקדמו להם.
דגימות אף נאספו ונבדקו כל שבועיים עד ארבעה שבועות על ידי בדיקת שרשרת תגובת שרשרת פולימראז בזמן אמת (RT-PCR) עד לבדיקה שלילית בדגימות עוקבות. תרבית ויראלית ורצף גנום שלם בוצעו על דגימות חיוביות.
על ידי ניתוח התרבות הנגיפית, העומס הנגיפי של חומצה ריבו-נוקלאית (RNA) ונתוני הרצף, החוקרים הגדירו אנשים שהיו בסיכון הגבוה ביותר לזיהום ממושך, את ההשפעות של טיפולים אנטי-ויראליים, והדינמיקה האבולוציונית של SARS-CoV-2 במצוקה חיסונית זו. אוּכְלוֹסִיָה.
ממצאי מפתח
זיהום ממושך ב-SARS-CoV-2 היה נדיר בקבוצה מגוונת זו עם מצב של פגיעה חיסונית בינונית עד חמורה. על פני מגוון רחב של מצבים מדכאים חיסוניים, נצפתה אבולוציה מוגבלת יחסית של SARS-CoV-2.
בזיהום לטווח קצר וארוך, קצב האבולוציה בתוך המארח היה דומה. משך התקופה הזיהומית בחולים מדוכאי חיסון נחשב לגורם המבדיל העיקרי.
בחולים שנדבקו לתקופות ממושכות, הצטברו מוטציות ב- RBD (Receptor binding domain viral). יתרה מזאת, נצפו מספר החלפות בשושלות Omicron הנוכחיות או הבאות.
חקירות לגבי גורמי סיכון חזקים גילו חוסר תפקוד או דלדול של תאי B, שעלולים להיגרם על ידי טיפול נגד CD20 או אנטי CD19, מיאלומה או לימפומה. תוצאה זו עולה בקנה אחד עם דיווחי מקרה שפורסמו בעבר, שבהם נצפתה ממאירות של תאי B בזיהומים ממושכים, ובכך הדגישה את התפקיד הקריטי של נוגדנים בפינוי SARS-CoV-2.
דיווחי מקרה קודמים תיעדו שכפול ויראלי ממושך באנשים שחיים עם זיהום בנגיף הכשל החיסוני האנושי (HIV). זה עולה בקנה אחד עם הניסיון של חולה אחד בקבוצת המחקר עם איידס שהיה לו תקופת הדבקה ממושכת של יותר מ-200 ימים. לחולה זה הייתה ספירת CD4 של פחות מ-50 תאים/μL והפגין שכפול לא מבוקר של HIV, שניתן לייחס אותו גם לחסינות הומורלית לקויה.
מסקנות
כמה מגבלות בולטות של המחקר הנוכחי כוללות את גודל המדגם הקטן עם דגימת מעקב שנבדקה חיובית ל-SARS-CoV-2 על ידי RT-PCR בזמן אמת, מה שהגביל את ההיקף לחקור תכונות רלוונטיות של אבולוציה ויראלית. כדי למתן את הטיה הפוטנציאלית בנוגע למצב של מדוכדך חיסוני, ההגדרה נשמרה בכוונה רחבה; עם זאת, זה הוביל גם להכללה של אנשים עם ליקויים חיסוניים מתונים עד מתונים, שסיכוי נמוך יותר לחוות זיהום ממושך.
מכיוון שכמעט 75% מהחולים לא קיבלו דגימת מעקב חיובית, תדירות איסוף הדגימות בין שבועיים לארבעה שבועות עלולה להיחשב נדיר מדי. מגבלה בולטת נוספת של מחקר זה הייתה היעדר קבוצת ביקורת חיסונית. יתר על כן, המחקר הנוכחי בוצע רק בתוך ארה"ב, ובכך הגביל את יכולת ההכללה של הממצאים.
המחקר הנוכחי בחן מבוגרים מדוכאי חיסון שהיו חיוביים ל-SARS-CoV-2 וציין משך זמן משמעותי יותר של זיהום ואבולוציה של הנגיף בחולים עם דלדול תאי B וממאירות. מוטציות בחולים מדוכאים חיסונית לא היו ניבויים חזק של מוטציות אומיקרון הבאות, מה שמצביע על כך שגישות חלופיות המבוססות על מעקב גנומי יכולות להיות שימושיות.
