מחקר שפורסם לאחרונה בפורסם ב הַנדָסָה מציג גישה חדשה לניתוח השפע הנמוך Nגליקופרוטום בפלזמת דם אנושי (HBP), שיכול לקדם משמעותית את גילוים של סמנים ביולוגיים בפלזמה.
חלבון גליקוזילציה ממלא תפקיד מכריע באבחון קליני ובביו -תרופות. עם זאת, הנוכחי Nשיטות גליקופרוטומיות מתמודדות עם אתגרים כמו זיהוי שגוי, קשיים באיתור נדיר ושינוי Nגליקנים, וכיסוי לא מספיק, במיוחד בדגימות מורכבות כמו פלזמת דם. כדי לטפל בסוגיות אלה, צוות המחקר פיתח חדשני Nזרימת עבודה גליקופרוטומית.
זרימת העבודה מתחילה בהדלדלות 14 חלבוני הפלזמה הדם הגבוהה ביותר בשפע (HAP) ואסטרטגיית שבר. אחריה עולה עיכול טריפטי והעשרת גליקופפטיד. לאחר מכן מנותחים הדגימות באמצעות ספקטרומטריה המונית ברזולוציה גבוהה עם פיצול התנגשות מדרגה (hcd.step ו- hcd.low). נוהל עץ החלטה חדש משולב לאימות נתונים.
תוצאות המחקר מבטיחות. זרימת העבודה בהכנת הדגימה מרחיבה את טווח הגילוי של גליקופרוטאינים בפלזמת הדם. זה יכול לאתר גליקופרוטאינים עם ריכוזים נמוכים כמו 6.31 pg · ml−1הרחבת הטווח בחמישה סדרי גודל בהשוואה לניתוח ישיר בפלזמה. זרימת העבודה של ניתוח הנתונים מאפשרת בידול אמין של דו משמע Nמבני גליקן. לדוגמה, זה יכול להבחין בין אנטנה לפוקוזילציה ליבה, כמו גם לזהות שינוי ונדיר Nגליקנים כמו אלה גופרים וגלוקורוניד.
בסך הכל, 1929 Nגליקופפטידים ו- 942 Nזוהו גליקוזיטים שמקורם ב 805 גליקופרוטאינים אנושיים-אמצעיים עד נמוכים. החוקרים גם זיהו גופרת וזרחנים Nגליקופפטידים בגליקופרוטאינים HBP נפוצים. יתר על כן, הם גילו שלושה נדירים Nאבני בניין של גליקן עם המונים של 176.0314, 245.0524 ו- 259.0672 DA.
זרימת עבודה חדשה זו לא רק משפרת את ההבנה שלנו לגבי גליקוזילציה של חלבון, אלא יש לה גם פוטנציאל ליישם בתחומים שונים. ניתן להשתמש בו כדי לחקור מועמדים של סמן ביולוגי ב- HBP, להעריך חלבונים ביו -יוטיים וללמוד מודלים ביולוגיים. למרות שלמחקר יש מגבלות, כמו זמן המדידה הארוך יחסית של המכשיר, הממצאים מספקים תובנות חשובות למחקר גליקופרוטומי עתידי. בסך הכל, מחקר זה מציע דרך חדשה לניתוח מעמיק של גליקופרוטאינים HBP וגילוי ביולוגי.
העיתון "דרכים חדשות לגילוי סמן ביולוגי בפלזמה של דם אנושי באמצעות ניתוח מעמיק משופר של השפע הנמוך נ-גליקופרוטום ", נכתב על ידי פרניה ג'יי זוניגה-באנואלוס, מרקוס הופמן, אודו רייכל, ארדמן ראפ.
