חוקרים ב-Academia Sinica פיתחו את המודלים הראשונים של ציון הסיכון הפוליגני (PRS) ספציפי לאוכלוסייה עבור אנשים ממוצא סיני האן, ומשיגים דיוק חסר תקדים בניבוי סיכונים למחלות נפוצות כמו סוכרת, מחלות לב, הפרעות אוטואימוניות. המחקר, שפורסם ב טֶבַע ב-15 באוקטובר 2025, ניתח נתונים גנומיים ובריאותיים של יותר מחצי מיליון משתתפים טייוואנים ביוזמת הרפואה המדויקת של טייוואן (TPMI) והדגים את הפוטנציאל הטרנספורמטיבי של גנטיקה ספציפית למוצא בשיפור הרפואה המדויקת ברחבי מזרח אסיה.
פתיחת מגוון אוכלוסיות במחקר גנומי
ציוני הסיכון הפוליגני משלבים את ההשפעות של מיליוני וריאנטים גנטיים כדי להעריך את הסבירות של אדם לפתח מחלות מורכבות. עם זאת, רוב דגמי ה-PRS הקיימים נבנו ממחקרים של אוכלוסיות מוצא אירופאיות, מה שהוביל לדיוק מופחת כאשר מיושמים על אחרים. כדי לסגור את הפער הזה, מדעני TPMI ערכו את מחקר האסוציאציות הגדול ביותר של הגנום (GWAS) של אנשים סיניים בהאן עד כה, תוך ניתוח של 695 מחלות ו-24 תכונות כמותיות על פני 463,447 משתתפים. הצוות זיהה 2,656 אסוציאציות גנטיות עצמאיות, כולל 95 גרסאות שלא דווחו בעבר, ומצא שהסיכונים הגנטיים מסבירים ביחד עד 10.3 אחוז מסך השונות הבריאותית באוכלוסיית טייוואן.
"הפרויקט הזה מסמן אבן דרך לרפואה מדויקת במזרח אסיה", אמרה ד"ר קאתי ס.-ג'יי. פאן, סופר מקביל בכיר במכון למדעי ביו-רפואה, אקדמיה סיניקה. "על ידי שילוב נתונים גנומיים וקליניים בקנה מידה גדול, אנו בונים מודלים חזויים המשקפים באמת את הארכיטקטורה הגנטית האמיתית של האוכלוסייה שלנו".
חיזוי מחלות משופר באמצעות מודלים ספציפיים לאוכלוסייה
באמצעות אלגוריתמים חדישים כגון LDpred2 ו-PRSmix+, החוקרים פיתחו ואימתו מודלים של PRS למאות מחלות, והשיגו ערכי שטח מתחת לעקומה (AUC) העולה על 0.8 עבור דלקת ספונדיליטיס וכ-0.7 עבור פסוריאזיס, פרפור פרוזדורים וסוג דלקת פרוזדורים, סוכרת. כאשר מיושם על קבוצות עצמאיות מה-Taiwan Biobank, UK Biobank ו-All of Us Project, ה-PRS שמקורו ב-TPMI הציג בעקביות ביצועים טובים יותר מהמודלים שהוכשרו על נתונים אירופיים עבור אוכלוסיות מזרח אסיה.
"התוצאות שלנו מראות כיצד חיזוי סיכון שפותח מקומי יכול לשפר באופן משמעותי את דיוק שירותי הבריאות", הוסיף ד"ר הונג-הסין צ'ן, המחבר הראשון והמתאים במכון למדעי ביו-רפואי, אקדמיה סיניקה.
ארכיטקטורה גנטית משותפת בין מחלות
ניתוחים של מתאמים גנטיים חשפו שלושה אשכולות עיקריים של תכונות – קרדיומטבוליות, אוטואימוניות/זיהומיות וקשורות לכליות – המצביעים על מנגנונים ביולוגיים משותפים (ראה איור 4 במאמר). מודלים Multitrait PRS שיפרו עוד יותר את ביצועי הניבוי, במיוחד עבור מחלות קרדיומטבוליות, שבהן השונות המוסברת גדלה פי 1.77.
תובנות חדשות לגבי הפטיטיס B ומחלות חיסוניות
תוך מינוף אפידמיולוגיה הייחודית של הפטיטיס B (HBV) של טייוואן, הצוות זיהה גם 19 לוקוסים גנטיים חדשים הקשורים לזיהום HBV ומצא מתאמים גנטיים הפוכים בין HBV ומחלות אוטואימוניות כגון תסמונת סיוגרן, פסוריאזיס וזאבת אריתמטוזוס מערכתית. תוצאות אלו מדגישות כיצד מערכי נתונים ספציפיים לאוכלוסייה יכולים לחשוף אינטראקציות בין גנים לסביבה בלתי נראות בקבוצות אירופאיות, ומציעות תובנות חדשות הן לגבי רגישות לזיהום והן לגבי ויסות חיסוני.
לקראת רפואה דיוק שוויונית
החוקרים מדגישים שמגוון גנטי חיוני לבריאות עולמית הוגנת. למרות שהם מייצגים כמעט רבע מאוכלוסיית העולם, אנשים במזרח אסיה מהווים פחות מ-4% מהמשתתפים במחקרים קודמים ברחבי הגנום. על ידי הפיכת נתוני TPMI לזמינים למחקר, הצוות מקווה לעורר מאמצים דומים ברחבי העולם.
"רפואה מדויקת צריכה לשרת את כולם, לא רק את האוכלוסיות שנחקרו הכי הרבה", אמר ד"ר חן. "העבודה שלנו מציעה תוכנית למדינות אחרות לפתח מסגרות חיזוי סיכונים ספציפיות לאוכלוסייה".
