מלבד נשיאת המידע לקידוד חלבונים פנימה, מולקולות RNA יכולות לאמץ מבני 2D ו- 3D מורכבים. באופן ספציפי, אותה מולקולת RNA יכולה מֶתֶג בין מבנים ומחוצה לה, שינוי היכולת של ריבוזומים להיקשר ל- RNA ולתרגם אותו לחלבונים. מחקר חדש, בהובלת הביולוג המולקולרי של אוניברסיטת גרונינגן, דני אינקרנאטו, ונכתב על ידי החוקרת הפוסט -דוקטורט ד"ר איוונה בורובסקה, מזהה מאות מתגי RNA רגולטוריים כאלה בחיידקים של E.coli ותאים אנושיים. זה פורסם ב טבע ביוטכנולוגיה ב- 25 ביולי.
לפני מספר שנים פיתחה אינקרנאטו שיטה למיפוי הצורות האלטרנטיביות שאומצו על ידי מולקולות RNA בתאים חיים. בשיטה זו הוא זיהה אזורים של RNA המסוגלים להקים מעצבים בין שני מבנים שונים, שלכל אחד מהם השפעה משלו. Incarnato: 'היכולת של RNA לעבור בין מבנים אלטרנטיביים מרמזת בדרך כלל על ויסות כלשהו, בדומה למתג כניסה.'
הצוות של אינקארנו השתמש כעת בשיטה זו כדי לחקור את המורכבות של מבני RNA בתאים חיים. יתר על כן, הם פיתחו כלי חדש שממנף מידע אבולוציוני כדי לזהות מתגים מבניים RNA פונקציונליים ברמת דיוק גבוהה. הם השתמשו בכלי כדי לחשוף מאות מהם. דוגמא אחת היא מתג המגיב לטמפרטורה ועוזר לחיידקים להגיב ללחץ קר. Incarnato: 'זיהוי מספר משמעותי של מתגים הוא צעד ראשון. השלב הבא הוא למצוא דרכים להשפיע על תפקודן. ' לדוגמה, ניתן לתכנן מולקולות קטנות כדי לשנות את המתגים הללו, מה שעלול בסופו של דבר להוביל לטיפולים חדשים למחלות.
המחקר הנוכחי, שלקח יותר משלוש שנים להשלים, בונה על שש שנים של מחקר מהותי בנושא איתור צורות RNA דו -ממדיות. אינקראטו: 'זה מהפכני, משהו שכל התחום מחפש כבר שנים.'
