יחידת הביוסטטיסטיקה, תוספת עדכנית לטכנולוגיות ולשירותים המוצעים על ידי מכון המחקר הגרמני Trias i Pujol (IGTP), מורכבת מצוות של סטטיסטיקאים ומתמטיקאים המבצעים ותומכים במחקר ביו-רפואי. לאחרונה הם פרסמו שני מאמרים בולטים. העיתון הראשון, המופיע ב דוחות מדעיים, חושף את תפקידם של אי-שוויון חברתי-כלכלי וחיסונים בהתפשטות מגיפת ה-COVID-19. השני, שפורסם ב מתודולוגיית מחקר רפואית של BMCמציגה את REDCapDM, חבילת R חדשה שנועדה לשפר את היעילות והאמינות בניהול נתוני המחקר שנאספו באמצעות פלטפורמת REDCap הפופולרית.
השפעת COVID-19 בקטלוניה: אי שוויון סוציו-אקונומי וחיסונים
מחקר מדעי חדש, שפורסם ב דוחות מדעיים מאת החוקרים Pau Satorra וכריסטיאן Tebé, שופך אור על האבולוציה וההשלכות של מגיפת COVID-19 בקטלוניה. באמצעות מודלים בייסיאניים מרחבי-זמניים, הניתוח חושף כיצד שכיחות הנגיף והאשפוזים השתנו בין אזורי בריאות בסיסיים שונים (ABS) לאורך זמן, תוך הדגשת גורמי מפתח שאולי השפיעו על מגמות אלו.
הממצאים מצביעים על כך שאזורים עירוניים חוו שכיחות גבוהה יותר של מקרים ואשפוזים בהשוואה לאזורים כפריים, מה שמצביע על קשר לצפיפות האוכלוסין ולתנאי החיים באזורים אלה. זה מדגיש את הצורך באסטרטגיות ספציפיות לבריאות הציבור בסביבות עירוניות מאוכלסות בצפיפות.
המחקר גם מצביע על השפעת אי השוויון החברתי-כלכלי על השפעות המגיפה. ABS עם רמות גבוהות יותר של חסך סוציו-אקונומי סבלו משיעורי אשפוז גבוהים יותר, מה שמדגיש כיצד תנאים סוציו-אקונומיים יכולים להחמיר את ההשפעות של משבר בריאות עולמי.
אחד הממצאים המשמעותיים ביותר הוא ההשפעה המגנה ברמת ABS של חיסון מלא נגד הנגיף, המדגימה את החשיבות החיונית של קמפיינים חיסונים במאבק במגיפה. הוכח כי כיסוי חיסונים מלא מפחית באופן משמעותי את הסיכון למקרים ולאשפוזים, ומאשר מחדש את המסר של בריאות הציבור לגבי חיסון ככלי מרכזי לשליטה בהתפשטות והשפעתו של הנגיף.
למחקר זה, נעשה שימוש בנתונים פתוחים שסופקו על ידי Generalitat de Catalunya, המדגישים את החשיבות של גישה למידע אמין ושקוף לקידום המחקר האפידמיולוגי. הגילויים של מחקר זה לא רק תורמים להבנה טובה יותר של הדינמיקה של COVID-19 ברמה המקומית, אלא גם מדגישים את החשיבות הקריטית של התערבות חיסונים ותשומת לב לאי-שוויון סוציו-אקונומי כמרכיבים מרכזיים בתגובה יעילה למגיפה.
"השימוש במודלים היררכיים בייסיאניים היה שימושי מאוד בתיאור המגמות המרחביות, הזמניות והמרחביות-זמניות של מגיפת COVID-19 בקטלוניה"אומר פאו סטוררה, המחבר הראשון של המאמר. "הראינו שלאזורי בריאות בסיסיים עירוניים יש סיכון גבוה יותר למקרי COVID-19 ולאשפוזים בהשוואה לאזורים כפריים, בעוד שקיפוח סוציו-אקונומי של האזור היה גורם סיכון לאשפוזים. בנוסף, הוכח כי כיסוי חיסונים מלא של הבריאות הבסיסית לאזור הייתה גם השפעה מגנה על הסיכון למקרי COVID ואשפוזים בכל אזור".
REDCapDM: חבילת R לניהול נתונים בפרויקטים של REDCap
במאמר שני זה, בהובלת João Carmezim ו- Pau Satorra, יחידת הביוסטטיסטיקה של IGTP פיתחה את REDCapDM, חבילת R חדשה שמטרתה להקל על ניהול נתונים עבור פרויקטי REDCap, יישום אינטרנט ליצירה וניהול של מסדי נתונים וסקרים מקוונים. REDCap נמצא בשימוש נרחב במחקר קליני בשל הגמישות ותכונות האבטחה שלו. עם זאת, ניהול נתוני REDCap באמצעות R יכול להיות מורכב, ולעתים קרובות דורש עבודת תכנות כדי למקסם את היעילות שלו. חבילת REDCapDM עונה לצורך זה, מספקת פונקציות ספציפיות לייבוא, טרנספורמציה, זיהוי אי התאמות וניהול נתונים.
באמצעות REDCapDM, החוקרים יכולים לייעל את תהליך ניהול הנתונים הקליניים תוך הבטחת האיכות והאמינות של המידע המנותח. כלי זה מעניין במיוחד מדעני נתונים ומנהלי נתונים קליניים העובדים עם REDCap ו-R, ומציע פתרון מקיף למשימות ניהול נתונים מחקריים.
היישום של REDCapDM ב-R, גרסה 4.3.0, וזמינותו באמצעות רשת הארכיון המקיפה R (CRAN) פותחת דלתות חדשות לניהול נתונים יעיל במחקרים קליניים. חבילה זו לא רק מפשטת את הייבוא והעיבוד של נתונים מ-REDCap ל-R אלא גם משפרת את תהליך אימות הנתונים, החיוני להפקת נתונים איכותיים במחקר.
הפיתוח של REDCapDM מסמן צעד קדימה באוטומציה ושיפור ניהול הנתונים במחקר קליני, ומספק לחוקרים כלים חזקים לניתוח ואימות נתונים. עם תמיכה מתמשכת מקהילת R ושילוב עם חבילות וכלים אחרים, REDCapDM אמור להפוך למשאב בעל ערך עבור קהילת המחקר הקליני העולמית.
היישום של REDCapDM בגרסה R 4.3.0, זמינותו באמצעות CRAN ו-Github מבטיחים גישה פתוחה לכלי זה ושקיפות, החיוניות להתקדמות המחקר המדעי. פרויקט זה, זמין עבור כל מערכות ההפעלה ותחת הרישיון הציבורי הכללי של GNU גרסה 2, מדגים את ההשפעה החיובית של שיתוף פעולה פתוח ושימוש בטכנולוגיות קוד פתוח בקידום המחקר הרפואי.
מהי חבילת R?
חבילת R היא אוסף של פונקציות, נתונים ותיעוד שפותחו כדי להרחיב את הפונקציונליות של התוכנה הסטטיסטית R. החבילות מאפשרות למשתמשים להוסיף טכניקות ניתוח חדשות, שיטות סטטיסטיות, גרפיקה, יכולות ייבוא וייצוא נתונים ועוד לסביבת העבודה R שלהם. חבילות אלו נוצרות על ידי קהילת המשתמשים והחוקרים R במטרה לשתף פתרונות ולהקל על עבודה על פרויקטים ספציפיים או בתחומי מחקר מסוימים.
