במחקר מוקדם* שפורסם לאחרונה ב- bioRxiv שרת, צוות חוקרים ניתח את המאפיינים הווירולוגיים וההשפעה האפידמיולוגית של תסמונת הנשימה החריפה הקורונה 2 (SARS-CoV-2) FLiRT וריאנט KP.2, אשר הוכיח יכולת העברה ועמידות חיסונית מוגברת.
מחקר: מאפיינים וירולוגיים של גרסת SARS-CoV-2 KP.2. קרדיט תמונה: Orpheus FX / Shutterstock
*הודעה חשובה: bioRxiv מפרסם דוחות מדעיים ראשוניים שאינם נבדקים על ידי עמיתים, ולכן אין לראות בהם מכריעים, מנחים פרקטיקה קלינית/התנהגות הקשורה לבריאות, או להתייחס אליהם כאל מידע מבוסס.
רקע כללי
ההופעה המהירה והגיוון של וריאנט JN.1 והצאצא שלו, KP.2, המראה שינויים משמעותיים במבנה חלבון ספייק (S) ועמידות מוגברת לחיסונים קיימים, מדגישים את הצורך במחקר נוסף כדי להבין את ההשלכות על בריאות הציבור. ופיתוח חיסונים.
לגבי המחקר
המחקר הנוכחי התחיל על ידי ניתוח הרצפים הגנומיים של וריאנט KP.2 מנתוני מעקב ברחבי ארצות הברית של אמריקה (ארה"ב), בריטניה וקנדה, שם דווחו למעלה מ-30 רצפים. מספר ההתרבות האפקטיבי היחסי (Re) חושב באמצעות מודל רגרסיה לוגיסטית רב-נומית בייסיאנית, תוך התאמה למשתנים שונים שיכולים להשפיע על דינמיקת השידור.
לאחר מכן, נערכו מבחנים וירולוגיים כדי להעריך את יכולות הזיהומים וההתחמקות החיסונית של KP.2. מבחני פסאודו-וירוס מבוססי-לנטי-וירוס בוצעו באמצעות תאי אוסטאוסרקומה אנושיים (HOS)- Angiotensin-Converting Enzyme 2 (ACE2)/Transmembrane Protease, Serine 2 (TMPRSS2) תאי נגועים בפסאודו-וירוסים הנושאים את חלבוני S של KP.2, JN.1, גרסאות רלוונטיות אחרות. כמות נגיף הקלט תוקנה כנגד חלבון קפסיד מסוג Human Immunodeficiency Virus Type 1 (HIV-1) Protein 24 (p24). ניתוח סטטיסטי בוצע באמצעות מבחני t דו-צדדיים של Student כדי לקבוע הבדלים משמעותיים בזיהומיות בין הגרסאות.
עבור מבחני הנטרול, נאספו דגימות סרום מאנשים במצבי חיסון וזיהום שונים. אלה כללו אנשים מחוסנים עם וללא זיהומים קודמים וכאלה שהחלימו מזיהומים וריאנטיים ספציפיים. כל דגימת נסיוב נבדקה ברבע עותקים נגד פסאודו-וירוסים המכילים מוטציות שונות של חלבון S. טיטר הניטרול של 50% (NT50) חושבו והשוו על פני כל דגימות הסרום כדי להעריך את מידת ההתנגדות לניטרול הנובעת מ-KP.2. מובהקות סטטיסטית של ההבדלים בערכי NT50 הוערכה באמצעות מבחנים דו-צדדיים של Wilcoxon Signed-rank.
תוצאות המחקר
המחקר חשף כי וריאנט KP.2, צאצא של שושלת JN.1, מפגין כושר אפידמיולוגי משופר משמעותית בהשוואה לקודמותיה, כולל שושלת XBB הדומיננטית. ממצא זה מאושש על ידי ה-Re הערכה עבור KP.2 בארה"ב, בריטניה וקנדה, שם הוא נצפה גבוה פי 1.22, 1.32 ו-1.26 מ-JN.1, בהתאמה. התפשטות KP.2 הייתה מהירה, כאשר תדירות הווריאציות שלו הגיעה ל-20% בבריטניה מתחילת אפריל 2024, מה שמצביע על פוטנציאל להפוך לשושלת השולטת בעולם.
חקירה וירולוגית נוספת של KP.2 באמצעות בדיקת פסאודו-וירוס מבוססת lentivirus הדגישה פרדוקס שבו, למרות יכולת ההעברה הגבוהה יותר שלו, נמצא כי הזיהום של KP.2 נמוך משמעותית (פי 10.5) מזו של JN.1. זיהום מופחת זה עשוי להצביע על מנגנונים או מסלולים שונים להתפשטות והתבססות משופרת של KP.2 באוכלוסיות המארחות.
בנוסף לזיהומיות, הוערכה עמידות לנטרול באמצעות מבחנים באמצעות סמים של אנשים שחוסנו בחיסון החד-ערכי XBB.1.5 וכאלה שהיו להם זיהומים פורצי דרך עם גרסאות שונות של SARS-CoV-2. KP.2 הפגין עמידות משמעותית לניטרול, עם הפחתה של פי 3.1 ברגישות לנטרול על ידי סמים מחיסונים ללא זיהום והפחתה של פי 1.8 מאלה עם זיהומים קודמים. התנגדות מוגברת זו יכולה להסביר חלקית את ה-Re הגבוה של KP.2, מה שמצביע על יכולת מוגברת להתחמק מתגובות חיסוניות בהשוואה ל-JN.1 וגרסאות קודמות אחרות.
*הודעה חשובה: bioRxiv מפרסם דוחות מדעיים ראשוניים שאינם נבדקים על ידי עמיתים, ולכן אין לראות בהם מכריעים, מנחים פרקטיקה קלינית/התנהגות הקשורה לבריאות, או להתייחס אליהם כאל מידע מבוסס.
