החוקרים חשפו כי לחלק מהסרטן הילדות יש מספר גבוה יותר של שינויים ב- DNA ממה שנחשב בעבר, ושינוי האופן בו אנו רואים בגידולים של ילדים ואולי פותחים אפשרויות טיפול חדשות או מחודשות מחדש.
מתרכז בסוג של סרטן כליות בילדות, המכונה Wilms Tumor, צוות בינלאומי רצף גנטית גידולים מרובים ברזולוציה שלפני כן לא הייתה אפשרית. שיתוף פעולה זה כלל חוקרים במכון וולקום סנגר, אוניברסיטת קיימברידג ', מרכז הנסיכה מאקססיקה לאונקולוגיה לילדים, מכון אונקוד בהולנד, בית החולים הגדול אורמונד, ובתי חולים באוניברסיטת קיימברידג' NHS קרן קרן.
הם חשפו שינויים גנטיים רבים יותר בתא סרטן מהצפוי, והוסיפו למיליוני שינויים לגידול. זה מצביע על כך שכמה גידולי ילדות עשויים להיות זכאים לטיפולים כמו אימונותרפיה.
במחקר, שפורסם היום (29 במאי) ב תקשורת טבעהצוות מתאר גם שינוי גנטי יחיד וספונטני הגורם לסוג נדיר של גידול וילמס, שאיתו ילדים נולדים, וכי שינוי זה מתרחש מוקדם במהלך ההתפתחות ברחם. הם גילו כי לגידולים אלה יש מראה מיוחד תחת המיקרוסקופ והפרופיל הגנטי, ומשמע כי זה יכול להיות אפשרי, בעתיד, לפתח טיפולים מותאמים אישית ולהתאים תוכניות קליניות לאנשים עם שינוי גנטי זה.
מחקר זה מאתגר את התפיסה הנרחבת כי לסרטן הילדות יש מספר נמוך מאוד של שינויים גנטיים ובמקום זאת מציע שיכולים להיות טיפולים יעילים למבוגרים שיכולים להיות מותאמים לגידולים בילדות בעתיד.
Wilms Tumor הוא סוג של סרטן כליות הפוגע במידה רבה בילדים מתחת לגיל חמש. בבריטניה מאובחנים כ- 85 ילדים עם גידול וילמס מדי שנה.
בעבר נהוג היה לחשוב כי לגידולים בסרטן הילדות, כמו אלה בגידול וילמס, היו מספר נמוך של שינויים גנטיים, המכונים גם גרסאות גנטיות.
כדי לחקור כיצד ומדוע גידולים אלה מציגים כל כך מוקדם בחיים, הצוות במכון סנגר ומשתפי הפעולה שלהם יישם את טכניקות הרצף הגנומיות האחרונות כדי להבין יותר כיצד ומתי התרחשו שינויים גנטיים אלה.
שיטות רצף גנום שלמות בתפזורת מאפשרות לחוקרים למצוא שינויים גנטיים המשותפים לכל התאים בגידול. אמנם זה יכול לעבוד טוב עבור גידולים למבוגרים, מכיוון שלתאים היה יותר זמן להתפתח, לגידולים בילדות יש פחות שינויים גנטיים משותפים, כלומר המספר הגדול של המוטציות שאינן משותפות לכל התאים מוחמצים.
כדי להתגבר על כך, הצוות השתמש בשתי טכניקות מתקדמות: רצף ננו, הידוע גם בשם NanoseQ, ורצף גנום שלם של אורגנואידים הנגזרים עם תאים יחידים כדי ללמוד גידולים בכליות ברזולוציה גבוהה בהרבה. שיטות אלה מאפשרות למדענים למצוא שינויים גנטיים שעשויים להיות קיימים רק בתא יחיד של סרטן.
הצוות השתמש בשיטות אלה לרצף גנטית WILMS דגימות גידול מארבעה ילדים, בני שישה חודשים. הם גילו שלתא סרטן יחיד היו 72 עד 111 שינויים גנטיים נוספים על גבי אלה שכבר זוהו בשיטות רצף גנום שלמות בתפזורת. המשמעות היא שכאשר מספר התאים הכולל בגידול נלקח בחשבון, ככל הנראה ישנם מיליוני שינויים גנטיים לכל גידול בסך הכל, ולא המספרים הנמוכים שנחשבו בעבר.
לצד שינוי ההבנה שלנו בגידולים בילדות, ממצא חדש זה יכול להיות בעל השלכות על הטיפול. החוקרים מציעים כי עם מספר זה של שינויים גנטיים אפשריים, סביר להניח שגידולים עלולים להיות עמידים בפני טיפולים מהר יותר, או שתרופות מסוימות עלולות לא לעבוד כלל.
עם זאת, תגלית זו עשויה גם לגרום לגידולים בילדות הם מועמדים טובים יותר לטיפולים קיימים המשמשים כיום לגידולים למבוגרים, כמו אימונותרפיות.
הצוות גם עקב אחר התפתחות הגידולים בשלושה ילדים וחשף מוטציה חדשה הגורמת לגידול וילמס. שינוי יחיד זה ב FOXR2 נמצא כי הגן מתרחש בזמן שהכליה התפתחה ברחם, וקשורה למראה מסוים של הגידול תחת המיקרוסקופ וקבוצה ספציפית של שינויי RNA. החוקרים מציעים כי ניתן להשתמש בכך לזיהוי גידולים אלה וכי יום אחד יתכן ופיתוח טיפול מותאם אישית ספציפי לפרופילים גנטיים מסוימים בגידול WILMS.
שיטות רצף נרחבות מועילות להפליא למספר גדול של גידולי סרטן, במיוחד אצל מבוגרים. עם זאת, הם לא מצליחים לתפוס את המורכבות הגנטית האמיתית של סרטן, במיוחד אלה המתרחשים בילדים הצעירים ביותר. בעזרת טכניקות רצף גנומיות אחרונות אלה, אנו יכולים כעת לראות תמונה הרבה יותר מפורטת של גידול וילמס, שיכולה להתרחש אצל ילודים. זה יכול לעזור לנו להבין את המצב הזה ביתר פירוט, ועשוי לשנות את הדרך בה אנו רואים ומתייחסים לגידולים בילדות בכללותם. "
ד"ר הנרי לי-סיקס, סופר משותף, מכון וולקום סנגר
ד"ר ג'רנו דרוסט, סופר סניור משותף במרכז הנסיכה מארסיקה לאונקולוגיה לילדים ובמכון Oncode בהולנד, אמר: "היכולת להתחקות אחר ההתפתחות של גידול יכולה לחשוף מידע מכריע על האופן בו הוא מתפתח. במחקר זה, חשפנו שינוי גנטי בודד שהתרחש במהלך התפתחותו של הטיפול בגידול בגידול. הורדת הסיכון להישנות, תוך צמצום ההשפעה שיכולה להיות על איכות חייו של ילד צעיר ומשפחתם.
פרופסור סם בהג'אטי, סופר סניור המשותף במכון וולקום סנגר ובבתי החולים באוניברסיטת קיימברידג ', אמר: "זו הייתה אמונה רחבה כי לגידולים בילדות היו מספר נמוך יותר של שינויים גנטיים מאשר גידולים בוגרים. עם זאת, בזכות התפתחותם של כל אחד מהזכרים שלנו. לתא מהצפוי, שמוסיף מיליוני שינויים נוספים בגידול, והדגיש כי מה שנוכל לראות קודם היה רק קצה הקרחון.
