טרשת רוחבית אמיוטרופית (ALS) היא מחלה ההורסת את העצבים הדרושים לתנועה. כ- 30,000 אנשים בארצות הברית מושפעים, והרופאים עדיין לא יודעים מה גורם לכך. כדי להניח את היסודות לבדיקות טובות יותר, חוקרי אוניברסיטת תומאס ג'פרסון פיליפה לוהר, אריק לונדין, PhD ו- Isidore Rigoutsos, PhD נוקטים בגישה ביולוגיה חישובית כדי לראות כיצד ALS משפיעה על מולקולות בדם.
במחקר שפורסם ב נוירוביולוגיה מולקולריתהצוות ניתח דגימות דם של כ -300 אנשים עם ALS וללא ALS. המחקר התמקד ב- RNAs קטנים שאינם מקודדים (SNCRNA), מולקולות קצרות המסייעות בוויסות ביטוי גנים ותהליכים סלולריים חשובים אחרים. עבודות עבר של ד"ר ריגוטסוס וצוותו במרכז לרפואה חישובית של ג'פרסון הראו כי מחלת פרקינסון השפיעה על רמות ה- sncRNA בדם. ד"ר ריגוטסוס רצה לראות אם זה נכון גם ל- ALS.
הצוות גילה שלאנשים עם ALS היו שילובים שונים של SNCRNAs בהשוואה לאנשים ללא, ו- SNCRNA מסוימים היו קשורים אפילו לכמה זמן אדם חי לאחר שאובחן.
מעניין לציין כי הניתוחים חשפו גם כמה SNCRNAs שלא היו שייכים לגנום האנושי.
ד"ר ריגוטוסוס אמר כי "הרבה מהמולקולות המשתנות עם המחלה נובעות מחיידקים או פטריות". בעוד שהקבוצה לא יודעת אם שינויים אלה הם סיבה או השפעה של ALS, התוצאות מצביעות על המיקרוביומה שממלאת תפקיד חשוב במצב.
ד"ר ריגוטוסוס אומר כי גישה ביולוגית חישובית, המנתחת כמויות מאסיביות של נתונים כדי למצוא דפוסים נסתרים של sncRNAs, תהיה המפתח להבנת מחלות ניווניות כמו ALS ויצירת אבחון ופרוגנוסטיקה טובה יותר לזמני הישרדות מדויקים יותר.
"אנחנו יכולים לבצע בדיקות במחשב שייקחו חודשים רבים, אם לא שנים, לעשות במעבדה," אמר. "זה מעבר לסוגי הדברים שאדם יכול לעשות פשוט על ידי התבוננות בגיליון אלקטרוני."
