צוות רב לאומי בראשות חוקרי Weill Cornell Medicine פיתח בדיקה שתסייע למדוד את התמדה של HIV באנשים שנפגעו מזנים ויראליים שנמצאו בעיקר באפריקה – כלי חיוני בחיפוש אחר תרופה ל-HIV שיועיל לחולים ברחבי העולם.
המחקר, שפורסם ב תקשורת טבע ב-2 ביולי, עוזר למלא פער גדול במחקר על נגיף הכשל החיסוני האנושי (HIV). רוב מחקרי ה-HIV התמקדו בזנים שמסתובבים במדינות מערביות, בעיקר בגברים שמקיימים יחסי מין עם גברים שנפגעו מתת-סוג B. מעט מחקרים בדקו זנים במחזור באפריקה, שם נשים מושפעות באופן לא פרופורציונלי.
מחקר לריפוי HIV נוטה להתמקד בזנים ויראליים שמסתובבים במדינות מפותחות, אבל כדי להשיג תרופה שישימה ברחבי העולם, עלינו לחקור זנים ויראליים המשפיעים על אזורים אחרים בעולם".
ד"ר גווינבר לי, עוזר פרופסור, וירולוגיה ברפואה, המחלקה למחלות זיהומיות, רפואת וייל קורנל
ד"ר Guinevere Lee הוא פרופסור עוזר למיקרוביולוגיה ואימונולוגיה ב-Wil Cornell Medicine.
הממצאים מראים – כמו מחקרים אחרים במדינות מפותחות – כי זני HIV המסתובבים באפריקה מקימים מאגרים ויראליים בגוף האדם. למרות שטיפול אנטי-רטרו-ויראלי יכול להפחית את רמת ה-HIV בדם לרמה בלתי ניתנת לזיהוי, המאגרים הרדומים הללו ממשיכים לשרוד. הם מכילים מספר רב של גנומים DNA פרו-ויראליים פגומים שאינם יכולים לייצר וירוסים זיהומיים חדשים, אך מספר קטן של גנומים נותרים שלמים גנטית ומוכנים לייצר וירוסים פעילים אם הטיפול האנטי-רטרו-ויראלי יופסק.
החלק הגדול של גנומים ויראליים פגומים מטשטש את ניסיונות החוקרים לכמת במדויק את העותקים של פרו-וירוסים שלמים. "אנחנו מחפשים מחט בערימת שחת: כדי להשיג תרופה ל-HIV, עלינו לברר תחילה אם פרו-וירוס שלם של גנום נשאר בגוף במהלך טיפול אנטי-רטרו-ויראלי. הבדיקה החדשה שלנו מאפשרת לנו לעשות זאת. לאחר מכן עלינו למקד ולחסל את ה-DNA הפרובירלי השלם המסוגל לייצר וירוסים חדשים", הסביר ד"ר לי.
הרחבת העדשה של חקר HIV עם בדיקה חדשה
ד"ר לי ועמיתיה ניתחו DNA מתאי חיסון הנקראים תאי CD4+ T, שבהם מסתתר DNA ויראלי, של 16 נשים ו-7 גברים שקיבלו טיפול אנטי-רטרו-ויראלי ב-HIV באוגנדה. ריצוף גנטי של הנגיף חשף שני תת-סוגים דומיננטיים של HIV-1: A1 ו-D (זן אגרסיבי הידוע לשמצה). המחקר זיהה גם הכלאות ויראליות של A1 ו-D.
לאחר מכן, הצוות שינה בדיקות מעבדה קיימות המזהות פרו-וירוסים מסוג HIV מסוג B כדי לזהות פרו-וירוסים שהם תת-סוגים A1 ו-D. "הניסוי החדש שפיתחנו יעזור לחוקרים להתרשם מהגנום הפרובירלי השלם הרלוונטי למחקר ריפוי HIV עבור חולים שנפגעו על ידי אלה תחת זנים שנחקרו", אמר ד"ר לי.
ד"ר לי ומשתפי הפעולה הרב-לאומיים, הרב-מוסדיים שלה, כבר משתמשים במבחן החדש כדי לחקור התמדה ויראלית ארוכת טווח באוגנדה. הממצאים שלהם מראים שהרכב הנוף הגנומי הפרווויראלי של HIV בר השוואה בין תת-הסוגים A1, D ו-B, מה שמצביע על כך שגישות למיקוד מאגרי HIV שלם באפריקה יתמודדו עם אתגרים דומים "מחט בערימת חציר" כמו בצפון אמריקה. אֵירוֹפָּה. מחקרים עתידיים יצטרכו גם להעריך הבדלים בתת-סוגים שאינם B כדי להבין אם גורמים ספציפיים לתת-סוגים משפיעים על התמדה, הפעלה מחדש או פינוי במאגרים ויראליים.
מחברים בכירים על המאמר כוללים את ד"ר אנדרו רד, המכון הלאומי לאלרגיה ומחלות זיהומיות במכון הלאומי לבריאות, וד"ר ג'סיקה פרודג'ר, עוזרת פרופסור, המחלקות למיקרוביולוגיה ואימונולוגיה ואפידמיולוגיה וביוסטטיסטיקה באוניברסיטת ווסטרן, קנדה.
חוקרים מאוניברסיטת סיימון פרייזר, קנדה; מרכז קולומביה הבריטית למצוינות ב-HIV/AIDS, קנדה; תוכנית רקאי למדעי הבריאות, אוגנדה; אוניברסיטת קייפטאון, דרום אפריקה; וגם בית הספר לרפואה של אוניברסיטת ג'ונס הופקינס תרמו למחקר זה.
המכונים הלאומיים לבריאות מממנים עבודה זו באמצעות מיזם המחקר לקידום מרפא ל-HIV (REACH) שיתוף הפעולה של מרטין דילייני, אשר מנוהל על ידי ד"ר בראד ג'ונס, פרופסור חבר לאימונולוגיה ברפואה וגם פרופסור חבר למיקרוביולוגיה. אימונולוגיה ב-Weill Cornell Medicine, וד"ר מרינה קאסקי, פרופסור למחקר קליני באוניברסיטת רוקפלר ופרופסור נוסף לרפואה ב-Weill Cornell Medicine ורופאה למחלות זיהומיות במרכז הרפואי ניו-יורק-פרסביטריאן/ווייל קורנל. REACH Collaboratory היא אחת מ-10 קבוצות מחקר שיתופיות במימון NIH ברחבי העולם המתמקדות במציאת תרופה ל-HIV.